PICRUSt功能预测软件安装

Ubuntu安装picrust

参考:http://picrust.github.io/picrust/install.html#install

##准备环境
pip install numpy==1.5.1
##后面用到h5py
sudo apt-get install libhdf5-dev
sudo apt-get install python-h5py

##如果运行脚本遇到numpy相关的问题,更新几个相关的库
pip install --upgrade numpy scipy pandas


##下载解压
wget https://github.com/picrust/picrust/releases/download/1.1.0/picrust-1.1.0.tar.gz
tar -xzf picrust-1.1.0.tar.gz
cd picrust-1.1.0

#下载好的 **16S拷贝数** 及ko文件放在picrust/data文件夹
##安装
sudo python setup.py install
最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

友情链接更多精彩内容