bwa+samtools+picardtools+GATK call SNP 流程
如何利用重测序进行SNP分析?
用GATK进行二代测序数据 SNP Calling 流程:(二)bwa比对和HaplotypeCaller 变异检测
变异分析
GATK官网
GATK流程
如何下载生物数据(三):GATK数据下载
shell脚本实现基因重测序和变异位点检测(附源代码)
重测序分析(附PCA与发育树构建)
从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第3节 数据质控
从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第1节 测序技术
从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第2节 FASTA和FASTQ
从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第3节 数据质控
从零开始完整学习全基因组测序数据分析: Trimmomatic、SOAPnuke、sickle和seqtk的比较
从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第4节构建WGS主流程
从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第5节 理解并操作BAM文件
如何使用Pysam处理BAM
GATK4.0和全基因组数据分析实践(上)
GATK4.0和全基因组数据分析实践(下)
GATK4全基因组数据分析最佳实践 ,我以这篇文章为标志,终结当前WGS系列数据分析的流程主体问题 | 完全代码