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workflowr简介
我们知道在win或者Linux上将自己的脚本上传到GitHub上我们可以通过Git插件轻松完成，那么在R上我们也可以做到将R脚本或者R markdown上传到GitHub上，并且以网页形式展现。通过R包 workflowr可以完成上传任务
想要达成这一功能的必要条件是：1.Rstudio；2.pandoc；3.Git
然后注册自己的GitHub账号就可以了
workflowr使用说明
1.安装
install.packages("workflowr")
这个包在CRAN上，直接安装即可
2.连接到GitHub
library("workflowr")#第一次连接wflow_git_config(user.name = "panl", user.email = "@qq.com")#更换账号wflow_git_config(user.name = "panl", user.email = "2461670636@qq.com",overwrite = T)
这样就连接成功了
2.创建repository
wflow_start("project")
这样我们就在对应文件夹下创建了project子文件夹
该工作流程特定的配置文件是_workflowr.yml。它将对所有R Markdown文件一致地应用到工作流重复性检查。另外最关键的设置是knit_root_dir，通过修改其设置，能确定将在其中执行文件的目录是analysis/。默认设置是在项目的根目录_workflowr.yml（即"."）中执行代码。要改为从analysis/中执行代码，请将设置更改为knit_root_dir: "analysis"
在可选的目录是data/，code/和output/。这些目录是推荐用来更好的管理整个项目的，但是如果你觉得它们没有用，可以将其删除。
data/：此目录用于存储原始数据文件。
code/：此目录用于可能不适合以R Markdown格式的代码（例如，用于预处理数据或长时间运行的代码）。
output/：此目录用于处理的数据文件以及从代码和数据生成的其他输出。
该目录中的该.Rprofile文件是常规的R脚本，在打开项目时运行一次。它包含调用library("workflowr")，确保每次打开workflowr程序项目时自动加载工作流程序。
3.构建网页
wflow_build()
并且出现界面：
查看站点：
wflow_view()
4.发布网页
(1)查看项目状态
wflow_status()
此时显示出整个项目的状态，一共有3个以Rmd结尾的文件
wflow_publish(c("analysis/index.Rmd","analysis/about.Rmd","analysis/license.Rmd"),"Publish the initial files for myproject")
紧接着将这3个文件publish
Summaryfromwflow_publish**Step1:Commitanalysis files**Nofiles to commit**Step2:BuildHTMLfiles**Summaryfromwflow_buildSettings:clean_fig_files:TRUEThefollowing were built externally eachintheir own freshRsession:docs/index.htmldocs/about.htmldocs/license.htmlLogfiles savedin/tmp/Rtmp8kxQNC/workflowr**Step3:CommitHTMLfiles**Summaryfromwflow_git_commitThefollowing was run:$ gitadddocs/index.html docs/about.html docs/license.html docs/figure/index.Rmddocs/figure/about.Rmddocs/figure/license.Rmddocs/site_libs docs/.nojekyll $ git commit-m"Build site."Thefollowingfile(s)were includedincommit8d38136:docs/about.htmldocs/index.htmldocs/license.htmldocs/site_libs/bootstrap-3.3.5/docs/site_libs/highlightjs-9.12.0/docs/site_libs/jquery-1.11.3/docs/site_libs/navigation-1.1/
5.部署网站
wflow_use_github("Githubname")#push到远端wflow_git_push()
之后再你的GitHub上部署网站，填写相应的GitHub的用户名，最后push到GitHub上去
参考：https://www.jianshu.com/p/653790f000d0
作者：小潤澤
链接：https://www.jianshu.com/p/1f8f39a93dd7
来源：简书
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