attr和prop分别是单词attribute和property的缩写（property：属性，attribute：特性），非常容易混淆，两个单词的中文翻译也都非常相近，但实际上，二者是不同的东西，属于不同的范畴。
attr与prop区别
对于HTML元素本身就带有的固有属性，在处理时，使用prop方法。
对于HTML元素我们自己自定义的DOM属性，在处理时，使用attr方法。
- 深层理解
在jQuery中，prop()函数的设计目标是用于设置或获取指定DOM元素(指的是JS对象，Element类型)上的属性(property)；attr()函数的设计目标是用于设置或获取指定DOM元素所对应的文档节点上的属性(attribute)。
当然，在jQuery的底层实现中，函数attr()和prop()的功能都是通过JS原生的Element对象实现的。attr()函数主要依赖的是Element对象的getAttribute()和setAttribute()两个方法。prop()函数主要依赖的则是JS中原生的对象属性获取和设置方式。
DOM固有属性
<a href="http://www.baidu.com" target="_self" class="btn">百度</a>
这个例子里<a>元素的DOM属性有“href、target和class"，这些属性就是<a>元素本身就带有的属性，也是W3C标准里就包含有这几个属性，或者说在IDE里能够智能提示出的属性，这些就叫做固有属性。处理这些属性时，建议使用prop方法。
自定义的DOM属性
<a href="#" id="link1" action="delete">删除</a>
这个例子里<a>元素的DOM属性有“href、id和action”，很明显，前两个是固有属性，而后面一个“action”属性是我们自己自定义上去的，<a>元素本身是没有这个属性的。这种就是自定义的DOM属性。处理这些属性时，建议使用attr方法。使用prop方法取值和设置属性值时，都会返回undefined值。
注意
对于表单元素的checked、selected、disabled等属性。
在jQuery 1.6之前，attr()获取这些属性的返回值为Boolean类型：如果被选中(或禁用)就返回true，否则返回false。
从1.6开始，使用attr()获取这些属性的返回值为String类型，如果被选中(或禁用)就返回checked、selected或disabled，否则(即元素节点没有该属性)返回undefined。并且，在某些版本中，这些属性值表示文档加载时的初始状态值，即使之后更改了这些元素的选中(或禁用)状态，对应的属性值也不会发生改变。
因为jQuery认为：attribute的checked、selected、disabled就是表示该属性初始状态的值，property的checked、selected、disabled才表示该属性实时状态的值(值为true或false)。
因此，在jQuery 1.6及以后版本中，请使用prop()函数来设置或获取checked、selected、disabled等属性。对于其它能够用prop()实现的操作，也尽量使用prop()函数。
property能够从attribute中得到同步；
attribute不会同步property上的值；
详情参考链接
参考
各种不同之处的比较
http://www.365mini.com/page/jquery-attr-vs-prop.htm
实现原理上介绍
http://www.cnblogs.com/elcarim5efil/p/4698980.html
