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1.根据lncRNA与疾病的关系，比如：
CCAT1：Colon
cancerassociated transcript-1；
MIAT：myocardial
infarction associated transcript，也叫RNCR2(retinal non-coding RNA2)；
UCA1：Urothelial
carcinoma associated 1 ,
HULC：Highly
Upregulated in Liver Cancer。
2.根据lncRNA与周围基因的位置，比如：
BACE1-AS：BACE1
antisense RNA；
HIF1A-AS2：LncRNAhypoxiainducible factor1alphaantisenseRNA-2
lincRNAHOTAIR：lincRNAHOXtranscript antisense RNA；
HOTTIP：lncRNA
HOXA transcript at the distal tip (HOTTIP)
而lncRNAasf的命名就直接是调控靶基因Fas的字母反过来。
3.根据lncRNA与基因上下游的调控关系，比如：
BANCR：BRAF-regulatedlncRNA1，
ATB：lncRNA-activated
by TGF-β，
PANDA：P21-associated
noncoding RNA DNA damage-activated。
4.根据lncRNA参与的生物学功能，比如：
LincRNA-ROR：Long
Intergenic Non-Protein Coding RNA, Regulator Of
Reprogramming，
Xist：X-inactive-specific
transcript，
GAS5：growtharrest-specific5。
5.根据在细胞内的定位，比如：
Neat1：LncRNAnuclear-enrichedabundant transcript 1。
当然，这是我们根据现在查到的分子进行总结的，有的就直接使用我们前面提到的ENST，RP等ID来用，也未尝不可。
