二代一些过滤软件

fataqc后可能需要对reads进行过滤
看文献总结一些相关软件
fastqmcf (v1.0)


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TrimGalore


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参考
https://www.jianshu.com/p/8af59c56e879
cutadapt 软件可以对NGS数据进行质量过滤
FastQC 软件可以查看NGS数据的质量分布
trim_galore 将这两个软件封装到一起,使用起来更加方便

比较推荐的 一款 能自动检测接头 自动去掉不好的reads 自动生成检测报告
fastp

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