新软件(其实出了很久了)，这两天部署好用了一下，感觉很不错。
安装
直接conda
conda install bioconda::bakta
软件最新版要6.0的数据库，软件主页提供的备用下载源下载的是5.1（反正我下载那会是），这个需要注意。当然网络“畅通”的话用正式源就能下载得到。
推荐的还是软件直接下载，我用light的数据库，轻量版本。
bakta_db download --output <output-path> --type [light|full]
使用
最基础就是指定输入输出文件和数据库路径即可：
bakta 你的.fasta --output 输出文件夹/ --db 你的数据库/全路径/
留意输出文件夹是否已经提前创建，可以在命令后加--force来强制输出到文件夹，运行前确保重要文件不存在于输出文件夹避免出现丢失问题。
bakta 你的.fasta --output 输出文件夹/ --db 你的数据库/全路径/ --force
一次注释只能提供一个fasta文件，批量注释需要自行撰写脚本进行。
输出结果
注释后获得的文件列表：
示例
有基因组的圈图，感觉真的方便，一般使用用途已经足够了：
GCF_000829055.1_ASM82905v1_genomic.png
相比prokka，获得的注释信息会更加的丰富，很多假定蛋白都有了对应的基因及产物结果，当然需要看你是什么菌了，反正我的是这样=。=
引用
bakta主页
注释菌株：Lacticaseibacillus casei DSM 20011 = JCM 1134 = ATCC 393 genome assembly ASM82905v1 - NCBI - NLM
