R package:xcms(六):Correspondence关联 /分组

代谢组学预处理的最后一步是匹配样品之间检测到的色谱峰的对应关系
即将前面检出的feature分组,组成一个表达矩阵。

pdp <- PeakDensityParam(sampleGroups = xdata$sample_group,
                        minFraction = 0.4, bw = 30)
xdata <- groupChromPeaks(xdata, param = pdp)

填补缺失值

xdata <- fillChromPeaks(xdata, param = ChromPeakAreaParam())

参考资料:
LCMS data preprocessing and analysis with xcms (bioconductor.org)

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