1928年石友三火烧少林寺，主要与当时的军阀混战局势以及少林寺卷入军事冲突有关：

-少林寺卷入军阀纷争：1926年北伐战争开始，樊钟秀的队伍被划到冯玉祥的第二集团军。1928年3月，因北伐战场战况激烈，冯玉祥将军队调往前线，河南空虚。樊钟秀接受奉系收买和策反，在河南聚集五万军队反叛，攻下十几个县城，还包围洛阳、禹州、登封和孝义兵工厂。而少林寺保寺团参加了樊钟秀的队伍，且樊钟秀的指挥部就设在少林寺。

-石友三恼怒之下纵火：当石友三的部队打入樊钟秀设在少林寺的指挥部时，樊钟秀的指挥部已撤离，寺内和尚也跑光了。石友三因樊钟秀撤离且少林寺僧众帮助樊钟秀一事十分恼怒，于1928年3月15日进驻指挥部后，一怒之下纵火焚烧了法堂。次日，驻防登封的国民军苏明启旅长，命军士抬煤油到少林寺中，将整个少林寺付之一炬，天王殿、大雄宝殿、藏经阁、钟楼鼓楼等重要建筑都陷入火海，大火烧了40天，一大批珍贵文物及5480卷藏经化为灰烬。