2022-06-07 文献阅读

(一)ARID1A prevents squamous cell carcinoma initiation and chemoresistance by antagonizing pRb/E2F1/c-Myc-mediated cancer stemness

主要结论:

(1)Mechanistic studies revealed that ARID1A blocked the interaction between cyclin-dependent kinases (CDKs) and retinoblastoma protein (Rb), reducing the phosphorylation of Rb. Dephosphorylated Rb suppressed E2F1 activity and then suppressed cancer stemness by inactivating c-Myc.
(2) ARID1A depletion significantly increased the chemoresistance of SCC and that a CDK inhibitor exhibited a favorable effect on rescuing the chemoresistance caused by ARID1A loss.
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主要逻辑:

ARID1A基因在肿瘤中失活突变很多,作者想研究它在鳞状细胞癌中的作用。先在基因敲除小鼠模型中发现失活突变,肿瘤易发生,这个模型算是一个亮点;然后在细胞系中敲掉基因,发现促进干性,促进生长;然后细胞RNAseq测序,发现敲除的细胞中,MYC相关通路最大,点QP也验证ARID1A的低表达,会导致MYC的转录本和蛋白上升;既然ARID1A可以影响MYC转录本,是不是与调控MYC表达的转录因子相关,然后就在上调通路中也有E2F,它是一个转录因子,发现E2F与MYC的启动子区域存在结合;后续发现ARID1A影响p-Rb,E2F,证明三者有互作,就做通了一个轴;后面就还涉及到上调通路中有EMT,EMT与化疗耐药相关,所以可能是ARID1A化疗耐药的原因之一,用CDKi可以克服,而CDKi主要也是可以靶向p-Rb,影响MYC表达。

个人收获点:

  1. the expression of stemness markers such as ABCG2, Nanog, and Sox2 and decreased the expression of differentiation markers such as Keratin 4 and Keratin 13.
    2.To further validate the role of ARID1A in the tumorigenic potential of SCC cells, a limiting dilution analysis was performed using KYSE410 cells expressing control or ARID1A shRNAs. 这里为了研究基因的致瘤能力,亦可反映肿瘤干性,作者用不同浓度的细胞数进行皮下成瘤,比较成瘤时间和大小。
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    3.EMT:the expression of the mesenchymal markers CDH2, ZEB1, and ZEB2 .
    EMT has been recognized as a contributor to chemoresistance in recent years [37];
    4.we predicted the sequence logo of E2F1 using the JASPAR database [32] (Fig. 5a), and further analysis showed that E2F1 could bind to several sequences in the c-Myc promoter region (2 kb upstream of the transcriptional start site) (Fig. 5b).
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Loss of ARID1A Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression via Up-regulation of MYC Transcription

diethylnitrosamine (DEN):可以诱导肝癌

MYC can be regulated by ARID1A and this contributes to the regulation of cell proliferation.

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