Single-cell transcriptomic analysis defines the interplay between tumor cells, viral infection, a...

     鼻咽癌是EBV有关的恶性肿瘤具有复杂的肿瘤生态系统。 肿瘤细胞,EBV之间如何相互作用,以及肿瘤微环境如何促进NPC的形成以及免疫的侵袭依然不是很清楚的。 在这里,我们对来自19个EBV+NPCs和7个非恶性鼻咽癌活检的104,000个细胞进行单细胞的RNA seq分析,同时找出了恶性细胞的转录组,EBV,胃,以及免疫细胞,总体来说,他们找到了整体的干扰素的上调在NPC的多细胞生态系统。 值得注意的是, 一个恶性细胞的上皮-免疫dual特性被发现,其于较差的预后有关。功能试验验证具有这个dual 特性的肿瘤细胞显示了较高的肿瘤形成的能力。 更进一步的关于肿瘤微环境的细胞成分的特征, 以及肿瘤细胞之间的相互作用揭示了肿瘤细胞的dual 特性与CD8+肿瘤浸润的T细胞的共表达抑制受体是正相关的。此外,发现具有dual特性的肿瘤细胞会抑制T细胞IFN-r的产生。 证明了其具有免疫抑制能力。他们的结果为多细胞的生态系统提供了观点, 并且提供了非常重要的临床应用。

Introduction

目前,也已经有了一些关于NPC的研究,NPC的研究大部分是bulk测序,单细胞测序比较少,本片文章用单细胞RNAseq的方法探索了NPC中恶性细胞,EBV,胃和免疫细胞,同时系统的比较肿瘤和非恶性组织的微环境。

Results:

Single-cell transcriptomic profiling of the multicellular ecosystem of NPC

(NPC多细胞生态系统的单细胞转录组)

An epithelial–immune dual feature in malignant cells of NPC

(在NPC的恶性细胞中,有上皮-免疫dual 特性)


T cell clustering and state analysis in NPC

(NPC中T细胞的聚类和状态分析)


Myeloid and stromal cell clustering and state analysis in NPC

(NPC中髓系细胞和基质的聚类和状态分析)


Global IFN response in the multicellular ecosystem of NPC

(在NPC中全局的IFN反应)


TME compositions and cell–cell interactions in NPC

(在NPC中的肿瘤微环境的形成以及细胞间相互作用)


Immune modulation and suppression of dual-feature tumor cells

(dual feature肿瘤细胞的免疫调控和抑制)

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