mkdir miniconda3 && cd miniconda3##千万不要写这一句,自作聪明,写了conda默认你装过不给你装了。。。
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
安装
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
中途输入一直yes
下去,直接下一句wget开始,一般直接帮你装在/root 或 /home,建议小白不要改来改去,免得后面环境变量啥的都不会改作死自己。
重新激活环境
source ~/.bashrc
配置镜像
一句句添加最妥,懒癌至少输入两句后再打开.condarc进行大幅度修改,至少那时你知道你打开的.condarc文件是正确的
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud//pytorch/
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
(base) [root@vicleo ~]# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
然后,需要在你安装conda的目录下(例如,你安装在/root下,就往、root找,conda info 后可查询PATH, env等,即可知道安装的地方)打开.condarc
删除掉channels下面的-defaults
一行,.condarc
常为隐藏文件
ls -a #显示隐藏文件
vim .condarc
创建小环境
conda create -n rna python=2
激活
windows ==> activate yourEnv
linux/mac ==> source activate yourEnv
linux用户可能需要进入到anaconda/envs目录下激活需要的环境;
linux用户如果不想每次都到目录下激活,需要进行全局环境变量设置,将需要激活的路径下的bin文件添加到全局环境变量中。如
将/home/yourName/anaconda3/envs/yourEnv/bin添加到~/.bash_profile中。
参考:https://www.boxuegu.com/news/934.html
安装软件
conda install samtools
或一次性装几个软件
conda install -y samtools subread
万一安装完之后中报错上不了网,你可以这样解决看看。
首先!因为你曾操作不当修改了.condarc
,然后会出现了一个.condarc.swp
的文件,那么你必须对其进行删除:
rm -rf .condarc.swp`
接着进行下面操作
摘录自:
rickcheung
王吉军
WYJ0726
1、CentOS 修改DNS
修改对应网卡的DNS的配置文件
vi /etc/resolv.conf
修改以下内容
nameserver 8.8.8.8 #google域名服务器
nameserver 8.8.4.4 #google域名服务器
2、CentOS 修改网关 修改对应网卡的网关的配置文件
[root@centos]# vi /etc/sysconfig/network
修改以下内容 NETWORKING=yes(表示系统是否使用网络,一般设置为yes。如果设为no,则不能使用网络,而且很多系统服务程序将无法启动) HOSTNAME=centos(设置本机的主机名,这里设置的主机名要和/etc/hosts中设置的主机名对应) GATEWAY=192.168.10.0(设置本机连接的网关的IP地址。例如,网关为10.0.0.2)
3、CentOS 修改IP地址
修改对应网卡的IP地址的配置文件
vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0
修改以下内容:
DEVICE=eth0 #描述网卡对应的设备别名,例如ifcfg-eth0的文件中它为eth0
BOOTPROTO=static #设置网卡获得ip地址的方式,可能的选项为static,dhcp或bootp,分别对应静态指定的 ip地址,通过dhcp协议获得的ip地址,通过bootp协议获得的ip地址 BROADCAST=192.168.10.255 #对应的子网广播地址
HWADDR=00:0c:29:d4:f313#对应的网卡物理地址
IPADDR=12.168.10.3 #如果设置网卡获得 ip地址的方式为静态指定,此字段就指定了网卡对应的ip地址
查看和修改网卡Mac地址(ifconfig命令)
ifconfig -a
eth0 encap:Ethernet HWaddr 00:0C:29:D4:F3:13
00:0C:29:D4:F3:13 即是你的MAC地址
IPV6INIT=no
IPV6_AUTOCONF=no
NETMASK=255.255.255.0 #网卡对应的网络掩码
NETWORK=192.168.10.0 #网卡对应的网络地址
ONBOOT=yes #系统启动时是否设置此网络接口,设置为yes时,系统启动时激活此设备
4、重新启动网络配置
service network restart
或
/etc/init.d/network restart
最后重启centos!