一、向量
1.标量和向量的区分
元素:指的是数字或者字符串
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
x<- c(1,2,3)
意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量
x<- 1:10
从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5)
1-10之间每隔0.5取一个数
x<- rep(1:3,times=2)
1-3 重复2次
二.从向量中提取元素
(1)根据元素位置
x[4]
x第4个元素
x[-4]
除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]
第2到4个元素
x[-(2:4)]
除了第2-4个元素
x[c(1,5)]
第1个和第5个元素
(2)根据值
x[x==10]
等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]
存在于向量c(1,2,5)中的元素
三:数据框
一定要将示例数据放在工作目录下
(1)读取本地数据
在工作目录中建好文件,读取本地文件li.txt
read.table(file="li.txt",sep="/t",header=T)
(2)设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt')
colnames(X)
查看列名
rownames(X)
查看行名,默认值的行名就是行号
colnames(X)[1]<-"bioplanet"
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)
最后row.names的意思是修改第一列为行名
(3)数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
分隔符改为逗号,字符串不加双引号
(4)变量的保存与重新加载
保存和重新加载。保存的格式是RData。save.image(file="bioinfoplanet.RData")
保存当前所有变量save(X,file="test.RData")
保存其中一个变量
load("test.RData")
再次使用RData时的加载命令
(5)提取元素
X[x,y]
第x行第y列
X[x,]
第x行
X[,y]
第y列
X[y]
也是第y列
X[a:b]
第a列到第b列
X[c(a,b)]
第a列和第b列
(6)直接使用数据框中的变量
提取某两列作散点图:
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)
脚本的使用和保存:将上面的代码复制到一个新的R脚本中。
然后保存到工作目录下,用Rstudio打就好。
问题:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
回答:1.可能X的大小写不一致;2.file中X数据可能不存在;3.括号可能写成了中文格式。