（1）断面法
对于江、河水系或某一河段，要求设置三种断面：a对照断面、b控制断面、c削减断面。
对照断面
设置目的：了解流入某一区域（监测段）前的水。
质状况，提供这一水系区域本底值。
设置方法：（位于该区域所有污染源上游处,排污口上游100～500m处）设在河流进入城市或工业区以前的地方。（避开各种废水、污水流入或回流处）
断面数目：一个河段区域一个对照断面。（有主要支流时可酌情增加。）
控制断面
设置目的：监测污染源对水质影响。
设置方法：（主要排污口下游较充分混合的断面下游）根据主要污染物的迁移、转化规律，河水流量和河道水力学特征确定，在排污口下游500—1000m处。因为在排污口下游500m横断面上的1／2宽度处重金属浓度一般出现高峰值。
对特殊要求的地区，如水产资源区、风景游览区、自然保护区、与水源有关的地方病发病区、严重水土流失区及地球化学异常区等的河段上也应设置控制断面。
断面数目：多个。根据城市的工业布局和排污口分布情况而定
削减断面
设置目的：了解经稀释扩散和自净后，河流水质情况。
设置方法：最后一个排污口下游1500m处。（左中右浓度差较小的断面。小河流视具体情况）
断面数目： 1个。
背景断面： （湖泊、水库监测断面的设置）
首先，判断是单一水体还是复杂水体：考虑汇入的河流数量，水体的径流量、季节变化及动态变化，沿岸污染源分布及污染物扩散与自净规律、生态环境特点等。然后，按照监测断面的设置原则确定监测断面的位置：
a.在进出湖泊、水库的河流汇合处分别设置监测断面；
b.以各功能区为中心，在其辐射线上设置弧形监测断面；
c.在湖库中心，深、浅水区，滞流区，不同鱼类的洄游产卵区，水生生物经济区等设置监测断面。
（2）采样点位的确定（三断面法采样部位的确定）：河流上 ——选取采样断面；采样断面上 ——选取采样垂线；采样垂线上 ——选取采样点。
（3）采样时间和采样频率的确定
所采水样要具代表性，能反映出水质在时间和空间上的变化规律，一般原则：
①对于较大水系干流和中、小河流全年采样不少于6次；采样时间为丰水期、枯水期和平水期，每期采样两次。流经城市工业区、污染较重的河流、游览水域、饮用水源地全年采样不少于12次；采样时间为每月一次或视具体情况而定。底泥每年在枯水期采样1次。
②潮汐河流全年在丰、枯、平水期采样，每期采样两天，分别在大潮期和小潮期进行，每次应采集当天涨、退潮水样分别测定。
③排污渠每年采样不少于3次。
④设有专门监测站的湖、库，每月采样1次，全年不少于12次。其他湖泊、水库全年采样两次，枯、丰水期各一次。有废水排入、污染较重的湖、库，应酌情增加采样次数。
⑤背景断面每年采样1次。
