资料引用
conda安装
- 添加镜像
添加镜像# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
- 过程
cd ~/biosoft
wget 软件下载网址https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
「for Windows」请记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了，选中，鼠标左键点一下是复制，右键点一下是粘贴；
「for Mac」直接cmd + c 复制，cmd + v粘贴
过程简单，最后一步需注意
source ~/.bashrc来激活conda
命令行输入conda，出现满屏的信息说明成功了
如果报错，说明你可能没有进行上一步的source ~/.bashrc命令。
conda使用
- 查看软件列表
conda list - 搜索软件
conda search fastqc - 安装软件
conda install fastqc -y - 卸载软件
conda remove fastqc - 建立新环境
conda create -n rna-seq python=3 - 查看conda 环境
conda info --envs - 激活conda环境，建立新环境后需激活，不同环境切换需要执行该命令
conda activate 新环境名 - 删除环境
rm -r 文件路径
