GSEA分析
gsego # 所需工具
需要文件
-1.genelist
-2.gene
参考图片
ggplot画图
KWGG Pathway 富集
-差异基因
-基因与KEGG Pathway的关系
准备文件
-TERM2GENE # Pathwag ID 与 Pathway Gene ID 的对应关系
-TERM2NAME # Pathway ID 与 Pathway Name 的对应关系
使用通用的富集方法。
目的
得到目标对象（基因或者基因产物）的富集结果（词条）后，通过查看网站对词条的注释声明，来验证或判断目标对象作为生物标志物的合理性。
内容
输入内容：一组基因或者基因产物（RNA、蛋白质）
知识图谱：往往是由符号连接的树状结构（DAG有向无环图）。
（1）有可能是描述功能的知识图谱，例如GO：描述“单个基因如何在分子，细胞和生物水平上的生物学贡献”。
（2）也可能是描述代谢通路的知识图谱，例如KEGG：一个整合了基因组、化学和系统功能信息的综合数据库，其中用的最多的数据库是描述基因通路的KEGG pathway
聚类：基于知识图谱进行映射分类
输出：
（1）富集结果。输入内容所映射的分类结果，一般包括数量和p值
（2）可以查看具体的分类的注释信息（知识库所体现的委员会意见和文献）
（3）具体分类所对应的局部知识图谱
WGCNA分析等等....
