文章信息

研究团队:湖北中医药大学1&韩林涛&黄芳等人
研究主题:白花蛇舌草T2T基因及活性成分合成通路研究
组学技术:基因组denovo+转录组+代谢组
百易汇能承担了本次测序服务!
研究背景
白花蛇舌草(茜草科)是一种具有重要治疗潜力的药用植物,其疗效主要归功于其具有生物活性的环烯醚萜类化合物。然而,该物种中环烯醚萜生物合成的分子机制仍不清楚,这限制了其在生物技术和制药领域的应用。
研究思路

研究结论
本文呈现了传统医学中重要药用植物白花蛇舌草 的关键基因组数据,报道了其大小为482.30Mb的端粒到端粒(T2T)基因组,该基因组包含16条染色体。研究发现白花蛇舌草在约3200万年前经历了一次全基因组复制事件。通过多组学分析,阐明了相关编码基因在环烯醚萜类代谢物生物合成途径中的调控作用,还预测出1个LAMT基因和2个CYP71D55基因是环烯醚萜类潜在后修饰过程中的关键酶。这项研究有助于更深入理解复杂的环烯醚萜类生物合成途径,并提升了白花蛇舌草作为药用植物的经济价值。

图1 系统发育及比较基因组研究

图2 利用代谢组学分析环烯醚萜类化合物在白花蛇舌草 5 种植物组织(根、茎、叶、花、果实)中的分布

图3 差异基因GO和KEGG富集分析

图4 环烯醚萜类生物合成途径的基因表达模式分析

图5 结合基因树的层次聚类热图预测了环烯醚萜类生物合成后修饰过程中的关键调控基因