单细胞交响乐总结
为何取名叫“交响乐”?因为单细胞分析就像一个大乐团,需要各个流程的协同配合
单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExperiment
单细胞交响乐2-scRNAseq从实验到下游简介
单细胞交响乐3-细胞质控
单细胞交响乐4-归一化
单细胞交响乐5-挑选高变化基因
单细胞交响乐6-降维
单细胞交响乐7-聚类分群
单细胞交响乐8-marker基因检测
单细胞交响乐9-细胞类型注释
单细胞交响乐9-细胞类型注释
单细胞交响乐10-数据集整合后的批次矫正
单细胞交响乐11-多样本间差异分析
单细胞交响乐12-检测Doublet
单细胞交响乐13-细胞周期推断
单细胞交响乐14-细胞轨迹推断
单细胞交响乐15-scRNA与蛋白丰度信息结合
单细胞交响乐16-处理大型数据
单细胞交响乐17-不同单细胞R包的数据格式相互转换
单细胞交响乐18-实战一 Smart-seq2
单细胞交响乐19-实战二 STRT-Seq
单细胞交响乐20-实战三 10X 未过滤的PBMC数据
单细胞交响乐21-实战三 批量处理并整合多个10X PBMC数据
单细胞交响乐22-实战五 CEL-seq2
单细胞交响乐23-实战六 CEL-seq
单细胞交响乐24-实战七 SMARTer 胰腺细胞
单细胞交响乐25-实战八 Smart-seq2 胰腺细胞
单细胞交响乐26-实战九 胰腺细胞数据整合
单细胞交响乐27-实战十 CEL-seq-小鼠造血干细胞
单细胞交响乐28-实战十一 Smart-seq2-小鼠造血干细胞
单细胞交响乐29-实战十二 10X 小鼠嵌合体胚胎
单细胞交响乐30-实战十三 10X 小鼠乳腺上皮细胞
单细胞交响乐31-实战十四 10X HCA计划的38万骨髓细胞
和《单细胞交响乐》的结缘~路漫漫