本文整理自生信星球

用于RStudio

1.标量和向量的区分

标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
一个向量是一排有序排列的元素，可作为数据框中的一列

image.png

从向量中提取元素

根据元素位置

x[1] # x第1个元素
x[-5] # 排除法，除了第5个元素之外剩余的元素
x[1:4] # 第1到4个元素
x[-(2:4)] # 除了第2-4个元素
x[c(3,5)] # 第3个和第5个元素

根据数值

x[x==10] #等于10的元素
x[x<0] #小于0的元素
x[x %in% c(1,2,5)] #存在于向量c（1，2，5）中的元素

数据框

（1）读取本地数据

read.table(file = "yang.txt",sep = "\t", header = T)
a<-read.table(file = "yang.txt",sep = "\t", header = T)

2 设置行名和列名

X<-read.csv('yang.txt') #在示例数据里有yang.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "yang.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#row.names为修改第一列为行名

3 数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带双引号） 

4变量保存与重新加载

#保存未处理完的数据，便于下次加载使用
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") #保存其中一个变量
load("test.RData") #再次使用RData时的加载命令

作业

作业：save(X,file="test.RData")，代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
使用save(x,file="test.RData")