一个引发Spark在Executor端Shuffle Write发生StackOverFlow的case

引子

有一天,一个客户带着下面StackOverFlow错误栈来找我,简单的主诉之后发现应该是shuffle wtrite阶段写中间文件的时候序列化发生了死循环。

java.lang.StackOverflowError
    at net.jpountz.util.SafeUtils.checkLength(SafeUtils.java:37)
    at net.jpountz.util.SafeUtils.checkRange(SafeUtils.java:29)
    at net.jpountz.lz4.LZ4BlockOutputStream.write(LZ4BlockOutputStream.java:151)
    at java.io.ObjectOutputStream$BlockDataOutputStream.drain(ObjectOutputStream.java:1876)
    at java.io.ObjectOutputStream$BlockDataOutputStream.write(ObjectOutputStream.java:1840)

客户:xss10m了,还是StackOverFlow,Spark好坑。。
我:莫不是lz4有bug,大佬,试试snappy
客户:(。。。。。。) 不行

ava.lang.StackOverflowError
        at org.xerial.snappy.SnappyOutputStream.write(SnappyOutputStream.java:123)
        at org.apache.spark.io.SnappyOutputStreamWrapper.write(CompressionCodec.scala:201)
        at java.io.ObjectOutputStream$BlockDataOutputStream.drain(ObjectOutputStream.java:1876

我:大佬要不试试不压缩 spark.shuffle.spill.compress false
客户:(。。。。。。)不行

java.lang.StackOverflowError
    at sun.misc.Unsafe.getLong(Native Method)
    at java.io.ObjectStreamClass$FieldReflector.getPrimFieldValues(ObjectStreamClass.java:1966)
    at java.io.ObjectStreamClass.getPrimFieldValues(ObjectStreamClass.java:1233)
    at java.io.ObjectOutputStream.defaultWriteFields(ObjectOutputStream.java:1532)
    at java.io.ObjectOutputStream.writeSerialData(ObjectOutputStream.java:1508)

我:你应用代码中是不是有定义新的类,但没有注册给Kyro
客户:是有
我:大佬试试?
客户:(。。。。。。)不行,心酸

java.lang.StackOverflowError
    at com.esotericsoftware.kryo.serializers.FieldSerializer$CachedField.<init>(FieldSerializer.java:689)
    at com.esotericsoftware.kryo.serializers.ObjectField.<init>(ObjectField.java:43)
    at com.esotericsoftware.kryo.serializers.UnsafeCacheFields$UnsafeObjectField.<init>(UnsafeCacheFields.java:295)

我:(这位大佬的耐心应该已近没有了,10086的技能用的差不多了)大佬还是把源码与我一阅吧。
客户:好。

// 客户源码占位符

测试1

拿到用户代码一看,虽然写的烂是烂了点,但这么短小应该不至于因为函数链太长二导致StackOverFlow。

简单模拟下,客户的场景

sc.range(1, 1000, 5).map(x => if (x % 2 == 1) (0, Seq(1, 2, 3)) else (1, scala.collection.mutable.LinkedList(2, 4, 6))).reduceByKey( (x, y) => x ++ y).filter(p => p._1 == 1).flatMap(p => p._2).take(1)

我:(肉眼一看,兄弟你这reduceByKey要来作甚。。。)大佬,您的case实际不需要,把reduceByKey去掉吧。。
客户:官文说reduceByKey性能好,我才用的。。。你不要骗我。。


315c9904576a98f96d5c6468026990b7.png

我:不是用这个还是用那个的问题,是直接不用。。大佬试试嘛
客户:(。。。。。。)神了。。不报错了,速度杠杠滴
我:大佬记住时时刻刻要“避免shuffle”啊。
客户:谢谢。

测试2

等等,今天把他shuffle搞掉了,改天再来个避无可避的怎么办?

还是等搞搞清楚

case 0

用户case的变种,模拟StackOverFlow

sc.range(1, 100000, 5).map(x => if (x % 2 == 1) (0, Seq(1, 2, 3)) else (1, scala.collection.mutable.LinkedList(2, 4, 6))).reduceByKey( (x, y) => x ++ y).filter(p => p._1 == 1).flatMap(p => p._2).take(1)

直接用bin/spark-shell --master yarn运行

spark.executor.instances=6
spark.executor.memory=5g
spark.executor.cores=1

任务失败,如期而至的StackOverFlow

Job aborted due to stage failure: Task 5 in stage 0.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 5.3 in stage 0.0 (TID 16, hzadg-hadoop-dev3.server.163.org, executor 9): java.lang.StackOverflowError +details
Job aborted due to stage failure: Task 5 in stage 0.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 5.3 in stage 0.0 (TID 16, hzadg-hadoop-dev3.server.163.org, executor 9): java.lang.StackOverflowError
    at java.lang.ref.WeakReference.<init>(WeakReference.java:69)
    at java.io.ObjectStreamClass$WeakClassKey.<init>(ObjectStreamClass.java:2306)
    at java.io.ObjectStreamClass.lookup(ObjectStreamClass.java:322)
    at java.io.ObjectOutputStream.writeObject0(ObjectOutputStream.java:1133)
    at java.io.ObjectOutputStream.defaultWriteFields(ObjectOutputStream.java:1547)
    at java.io.ObjectOutputStream.writeSerialData(ObjectOutputStream.java:1508)
    at java.io.ObjectOutputStream.writeOrdinaryObject(ObjectOutputStream.java:1431)
    at 
....
....
....
    at java.io.ObjectOutputStream.defaultWriteFields(ObjectOutputStream.java:1547)
    at java.io.ObjectOutputStream.writeSerialData(ObjectOutputStream.java:1508)
    at java.io.ObjectOutputStream.writeOrdinaryObject(ObjectOutputStream.java:1431)
    at java.io.ObjectOutputStream.writeObject0(ObjectOutputStream.java:1177)

case 1

先把reduceByKey改成groupByKey试试看,是不是只要有shuffle就会有问题,要是那可能就是spark带的bug或者限制了。

sc.range(1, 100000, 5).map(x => if (x % 2 == 1) (0, Seq(1, 2, 3)) else (1, scala.collection.mutable.LinkedList(2, 4, 6))).groupByKey(10).filter(p => p._1 == 1).flatMap(p => p._2).take(1)
res2: Array[Seq[Int]] = Array(LinkedList(2, 4, 6))

执行成功,所以Spark自带问题的可能性极小

case 2

那是不是数据太大的问题呢,再把数据量改小试试

scala> sc.range(1, 1000, 5).map(x => if (x % 2 == 1) (0, Seq(1, 2, 3)) else (1, scala.collection.mutable.LinkedList(2, 4, 6))).reduceByKey( (x, y) => x ++ y).filter(p => p._1 == 1).flatMap(p => p._2).take(1)
res3: Array[Int] = Array(2)

执行成功,说明数据量的确会触发这个问题,看来是reduceByKey把Value的List Combine的过大了,但是数据不是存在堆里的吗,怎么也应该以是OOM而不是StackOverFlow嘛。。

case 3

带着一丝疑问,以及最初对客户代码烂的疑惑,我们把LinkedList改成Seq,使得map的output对象一致试试,数据量还是保持在之前出错的级别

scala> sc.range(1, 100000, 5).map(x => if (x % 2 == 1) (0, Seq(1, 2, 3)) else (1, Seq(2, 4, 6))).reduceByKey( (x, y) => x ++ y).filter(p => p._1 == 1).flatMap(p => p._2).take(1)
res4: Array[Int] = Array(2)

执行成功

再增大一个数量级?

scala> sc.range(1, 1000000, 5).map(x => if (x % 2 == 1) (0, Seq(1, 2, 3)) else (1, Seq(2, 4, 6))).reduceByKey( (x, y) => x ++ y).filter(p => p._1 == 1).flatMap(p => p._2).take(1)
res5: Array[Int] = Array(2)

还是成功了,看来这个锅是scala的集合的咯,在大数量下,可变集合和不可变集合反复连接后,序列化貌似触发scala内核的bug

// TODO 对scala的集合类型进行深入的分析

总结与建议

  1. 首先在我们的Spark程序中,能避免shuffle就尽量避免shuffle
  2. 当shuffle不可避免的时候,reduceByKey,groupByKey等shuffle算子虽然性能上很直观的可以从字面上可以很容易评价,但是还是有不同的使用场景,用慎重选择
  3. scala的集合要用好,尽量不要随便的混用,避免一些坑,最好就是好好的研究学习摸索一番

尾声

把测试结果告诉了客户,客户很高心,KPI有望了。。。

我呢,哦,问题又来了。。。

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 215,294评论 6 497
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,780评论 3 391
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 161,001评论 0 351
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,593评论 1 289
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,687评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,679评论 1 294
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,667评论 3 415
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,426评论 0 270
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,872评论 1 307
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,180评论 2 331
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,346评论 1 345
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,019评论 5 340
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,658评论 3 323
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,268评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,495评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,275评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,207评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容