1 HLA表达的抗原决定着集体的组织相容性。通过识别非己细胞的肽段可以呈递到T细胞进而杀死非己细胞；
2 癌症细胞具有大量突变，原则上可以表达更多的非己抗原，但因为免疫逃逸机制如PD-1 PD-L1通路等可能逃避HLA表达抗原的识别。
3 根据肿瘤样本中的大量突变（主要为编码区域的致病突变）预测突变后的氨基酸序列（肽段），目前主要依赖于netMHCpan软件，通过机器学习的方法进行预测。在确定该患者HLA亚型下，主要依赖于optitype软件，找到突变肽段中与确定HLA亚型具有强亲和力的肽段。（三步：1 确定HLA亚型；2 根据患者突变预测可能产生新抗原的肽段；3 分析HLA亚型和肽段的亲和力，筛选高亲和力的肽段）
4 以上肽段更有可能作为HLA识别的区域，以便HLA结合该区域将肿瘤细胞呈递到T细胞并杀死。
5 涉及以上肽段作为新抗原，外来肽段进入体内诱发HLA识别呈递，启动免疫反应。进而教会HLA识别肿瘤细胞中的该肽段，重启杀死肿瘤细胞的机制。
2022-03-02 新抗原预测
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