0701coming

最近在看网络药理学相关的内容
推荐一个好用的网站,根据蛋白质uniprot转换为基因名(无需代码)
https://www.uniprot.org/uploadlists/
网站名字就叫做Uniprot,直接提交就好

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只需要两步就好,第二步选择只需要from uniprot to gene name
或者ensemble name / entrez ID都可以,看自己的需要吧


之前试过应用R中org.Hs.eg.db包进行gene name 和 gene symbol结合,然后合并,但是写代码过程中发现gene name与uniprot的name并不一致,例如org包中ACHE的gene name 是“acetylcholinesterase (Cartwright blood group)”,uniprot中的name是“Acetylcholinesterase”,虽然一致,但是内容不完全相同,我的能力是没办法实现这种合并了,所以放弃而使用在线网站转换,又快又不用动脑筋。

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