DNA浓度计算拷贝数方法

核酸浓度单位是ng/μL。
平均分子量(MW):克/摩尔,单位道尔顿(dolton),即1dolton=1g/mol
dsDNA=(碱基数)(660道尔顿/碱基) 或 dsDNA=(碱基数)(650道尔顿/碱基)
ssDNA=(碱基数)(330道尔顿/碱基)
ssRNA=(碱基数)
(340道尔顿/碱基)

每mol物质含有阿佛加德罗常数个微粒:1mol =6.02*10^23copies

浓度(g/ml)* 体积(ml)=平均分子量(g/mol)摩尔数(mol)
摩尔数(mol)= 浓度(g/ml)
体积(ml)/平均分子量(g/mol)
总copies数=(浓度(g/ml)* 体积(ml)/平均分子量(g/mol))6.0210^23copies/mol
总copies数浓度=浓度(g/ml)6.0210^23copies/mol/平均分子量(g/mol)

拷贝数计算公式:
copies/ml = 浓度(g/ml)6.0210^23(copies/mol)/MW(g/mol)
copies/ml = 浓度(g/ml)6.0210^23(copies/mol)/(DNA长度660)
copies/ul = 浓度(ng/ul)
6.0210^23(copies/mol)/(DNA长度660*10^9)

摩尔浓度计算公式:
摩尔数(mol)=浓度(g/ml)* 体积(ml)/平均分子量(g/mol)
摩尔浓度(nmol/L)=浓度(ng/ul)10^6/500660(g/mol)

dsDNA文库质量浓度(ng/μL)和摩尔浓度(nM)换算:


image.png

dsDNA拷贝数计算:


image.png

根据DNA质量计算总拷贝数,去掉体积即可

如:1ng/μL DNA,片段长度20Kb,计算如下,


image.png
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