这可能是一篇以英国为中心的独特博文，但我怀疑不是。让我从一个简短的故事开始。几周前，我坐在食堂里喝咖啡，无意中听到几个PI之间关于助学金申请的对话。“别担心”，首席PI说，“我们已经在申请上投入资金，资助一名生物信息学者”。很好的计划，我听你说，我同意；然而，请注意，讨论中没有一位PI本身就是生物信息学者；他们都不会编码；把他们放在Linux终端前，他们不知道该怎么办。

是的——我们见证了另一位“pet bioinformatician”的诞生。我所说的这个术语是指在实验室团队中雇佣的单个生物信息学者。这些家伙在英国学术团体中越来越常见，这让我很担心，因为他们可能会变得孤立，并接受不良做法，因为他们没有高级生物信息学者来指导他们。我还担心他们的职业和专业发展可能会受到影响。考虑一下相反的情况——PIS管理实验室人员有多少人？我们怎么可能指导一个年轻的博士后如何运行凝胶、PCR等，而不需要更复杂的实验室标准工作流程？我们不能——那么为什么基于湿实验的PI认为他们可以指导生物信息学者呢？

当你不具备员工在所选领域生存所需的技能时，必须考虑如何培养年轻或缺乏经验的员工。当你不了解自己时，你如何帮助他们？

本指北针对宠物生物信息学者，旨在指导他们更好地职业发展。

1.与当地的生物信息学团体交朋友

你可能不在当地的生物信息学小组，但如果有，就去找他们，介绍你自己，交朋友。询问你是否可以参加他们的实验室会议和期刊俱乐部。告诉小组组长，你希望确保学习生物信息学的良好实践，并希望得到他们的帮助。如果你所在的研究所没有，那么地理上最近的研究所在哪里？你能去见他们吗？如果是，就去做；如果没有，尝试使用skype进行会议等。与互联网上的人和团体建立电子关系。建立一个支持小组，该小组将能够帮助您解决实验室小组无法解决的问题。

2.和你的计算机小组谈谈

找到他们，告诉他们你的工作是关于什么的，你需要什么资源，并询问他们如何在你所处的环境中最好地访问这些资源。如果您不知道需要哪些资源，请参见上文第（1）点。您当地的IT团队对您的成功至关重要。与linux系统管理员交朋友，他们可能会救你的命。

3.获得明确的期望

与你的老板交谈，让他们准确地概述他们对你的期望。如果你是靠补助金获得资金的，那就去申请补助金，并仔细阅读你的经理承诺你将提供的内容。让你的老板做好准备，让他们知道他们的期望可能需要改变，特别是如果他们不现实的话。

4.重写你的工作描述

用（3）和（1）和（2）改写你的工作描述，让你的经理充分意识到你能做什么，不能做什么。让他们知道事情需要多长时间，因为他们可能不知道。尽早这样做。如果他们不同意你对你能提供什么的估计，请向（1）寻求支持。给出现实的估计。请您的经理确定目标的优先级。

5.论文

你需要第一作者的论文，就像其他科学家一样。中间作者的论文只会让你走到这一步。提前告诉你的老板你的下一篇第一作者论文来自哪里。解释一下，对于某些项目，你会比实验室的人做更多的工作，所以应该获得第一作者资格（只有在这是真的情况下才这样做）。如果不存在任何可能性，请允许你发展自己的想法并发表。与（1）中的人交谈。

6.参加生物信息学会议

您的经理希望您参加与团队研究相关的会议。去这些地方，但也要求参加生物信息学会议和研讨会。

7.先试试，以后再问

这是一个微妙的平衡行为。没有什么比掌握一些数据或代码并尝试一下更好的方法了。尝试坐下来读一读，尽可能努力解决你遇到的任何问题。但请注意，您提出的解决方案可能是次优的。一段时间后，寻求帮助。向更有经验的人展示你所做的，并征求反馈。充分利用你所学到的知识和得到的反馈，把剩下的留给别人。没有人喜欢过早寻求帮助并希望别人告诉他们该做什么的人；我们都喜欢实践者。但不要走得太远；首先尝试你自己的方式，但在某个时候休息一下，寻求反馈和帮助。

我见过不止一个项目的结果几乎是100%的垃圾，因为一个生物信息学者是孤立的，没有寻求帮助。不要做那种人。别让你自己这么做。与其他生物信息学者在一起应该可以降低这种风险，因为他们能够在一切为时已晚之前发现你的错误。

确保你和团队中的其他成员一样受到高度重视，你的职业生涯得到了培养，你的技能得到了与团队中其他成员一样的发展。确保你的工作符合明确和现实的期望，并积极参与（重新）定义你的角色和工作描述。

如果你在学术界，就出版吧。请发表。中间作者是可以的，但如果你不想被视为一个促进者，第一作者是必不可少的。目标是一年写两篇论文。如果你的老板不能为你提供(课题)，你自己去做，发表review，发布软件工具的比较。抓住你遇到最多的问题，解决它并发布解决方案。一开始，这似乎让人望而生畏，但要寻求帮助，你能做到。

照顾好你们自己，宠物生物信息学者。

多看文章多思考，有想法就动手去做，遇到困难寻求帮助，good luck and good health！

end

reference: http://www.opiniomics.org/a-guide-for-the-lonely-bioinformatician/