从BioMart中下载拟南芥和小麦的直系同源基因(Orthologues)

从BioMart中下载拟南芥和小麦的直系同源基因(Orthologues)

step1:进入EnsemblPlants网站https://plants.ensembl.org/index.html

step2:点击BioMart

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step3:选择合适的数据库,这里选拟南芥的基因

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step4:选择要导出的数据,这里选定导出拟南芥的基因ID,以及拟南芥和小麦的orthologues

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选择小麦的基因ID

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step5:点击Results

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step6:选择导出的文件格式,点击Go,导出结果

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导出的文件中包含所有拟南芥基因32833个(包含非编码基因)和与拟南芥直系同源的51147个小麦基因。(PS:如果最开始的数据库选的是小麦的,后面的orthologues选的是拟南芥的,则结果为包含小麦所有基因和拟南芥部分基因)

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