rmarkdown基本语言整理

本篇文章只是站在巨人的肩膀上做的学习整理，如有侵权，立即删除。

本篇内容包括：

markdown基础文本编辑语言

markdown公式和表格插入

rmarkdown目录的插入

rmarkdown是Rstudio里自带的markdown编辑器，过后会发一篇关于怎么在Rstudio里怎么操作rmarkdown的文章以做记录。

一.标题

其实就是编辑字体大小

在标题前加#（最多只有6级，#越多字体越小）
```
 #一级标题

 ##二级标题
```

在标题下方加下滑线（目前只发现有两级）

 一级标题  
 ====================

 二级标题
 ---------------------

二.块注释

通过在文字开头添加 > 表示块注释。
在块注释时，可以每一行都用 >，也可以只在整个段落的第一行最前面加上 >（当 > 和文字之间添加五个blank时，块注释的文字会有变化。）:

    >块注释

    >     块注释（有5个空格）

当有多层次的引用时，也可根据层次的引用应用嵌套式，只要加上不同数量的 >

    >第一层引用

    >>第二层引用

三.列表

有序列表

使用数字后面跟上句号.(注意是数字的句号)，本篇都是运用了有序排列，就不再给出另外的效果了。

值得提醒的一点是，当你的第一个序号是1时，markdown能够自动帮你排列接下来的顺序，如果接下来的代码是：

    1. 第一行
    186. 第二行

出来的结果也将是(以下效果是二.块注释)：

第一行

第二行

那如果某一行开头就是个数字，且数字格式刚好是数字-句点-空白怎么办？我们就可以在数字句点前面加上** \ **：

      1. 第一行
      
      186\. 第二行

无序列表

无序列表使用星号、加号或是减号作为列表标记，效果都一样：

      *星号
      
      +加号
      
      -减号

四.强调

斜体

使用星号和底线作为标记强调字词的符号：

      *星号*
      
      _底线（注意是英文的底线）_

但似乎底线只能用在顶格地方，否则将不出效果

加粗

使用2个星号或者 2个底线：

      **星号**
      
      __底线__

五.插入代码

（不让其运行，只起到说明作用的代码）

标记简单的行内代码，可直接用`包起来

   `注意这个符号是英文的最左上角的~键，不是英文的引号`

标记大片代码需要实现代码框，使用4个Tab键

   本篇文章的代码都是采用此种方法，因为本人觉得这种比较简单且好看

六.脚注

    [^内容]: 脚注

七.分隔线

可以在一行中用三个以上的星号、减号、底线来建立一个分隔线，行内不能有其他东西。也可以在星号或是减号中间插入空格。下面每种写法都可以建立分隔线：

    * * *
    
    ***
    
    *****
    
    - - -
    
    ---------------------------------------

为什么不直接用空格回车？因为空格回车无论回车多少行，最后出来的结果也只是换行，并没有分隔段与段的效果

八.插入链接

内链式（行内式）：
```
   [参考文献](文献地址)
```

2.参考式：

      此篇引用参考文献[文献1][1]，[文献2][2]和[文献3][3]
      
      [1]:地址1
      
      [2]:地址2
      
      [3]:地址3

本篇文章最后文献链接处采用的是内链式

九.插入图片

内链式（行内式）：
```
 ![图片名称]（图片地址）
```

参考式：

 图片有![图片1][1]，![图片2][2]和![图片3][3]
   
   [1]:地址1
   
   [2]:地址2
   
   [3]:地址3

图片和链接的区别就是在前[ ]会多一个！* *
且插入的图片对网页的图片要求较高，本人目前水平只能达到插入纯图片，若网页有较多图片或者图片内富含链接，用以上代码将无法显示

十.插入公式

在行中插入公式，直接用$或 $公式$
```
 $数学公式$

 $公式$
```
在文中插入独立公式，其可以独立成行，需用2个$ 或 \$公式\$
```
 $$数学公式$$

 \$公式\$
```

可自动编号的公式，格式为

 \begin{equation}
 数学公式
 \label{eq:当前公式名}
 \end{equation}

根据xiahouzuoxin博客的 Markdown中插入数学公式的方法来看，以上3中方法都使用了MathJax引擎，在使用前需要添加Mathjax的引擎，但在rstudio中实现却不需要，不知道是不是这款编辑器自带？

**超详细的公式的格式及语法可参考 @-潘嘉豪整理的 Cmd Markdown 公式指导手册 **

十一. 表格绘制

打代码时无需特别对称，但格式一定要正确

    |                 | 变量1         | 变量2 |
    | ------- |:------:| -----:|
    | 样品1     | 数据 | 数据|
    | 样品2     | 数据      |   数据 |
    | 总计 | 数据      |    数据 |

十二. 目录插入

找到rmaekdown窗口的设置：

目录1.png
找到设置中的output opions选项进行设置：

目录2.png
在设置的窗口中选择红框标记的两个选项，勾选第一个是自动生成目录，下面有一个Depth of headers for table of contents，这里是设置你希望把几级以下的文字设为标题；第二个红框则是选择目录的主题样式：

目录3.png

参考文献：