肿瘤科医生是一个既要看病、做手术又要熬夜看文献、写标书的苦逼职业。2022年影响因子更新在即，想发高分SCI 越来越难，今天DLAB实验室就教你一招发10分文章的好套路。目前SCI成果中，医生外包实验导致图片问题层出不穷。

如果给大家揭秘一种比外包实验更安全，比外包实验价更低，且医生可亲自参与的科研方式“文章vs.专利vs.基金=转录组测序+临床样本”，是不是一个价值千金的idea，你看它香是不香?

1转录组到底是什么呢？

转录组根据RNA种类，可以分为mRNA测序，SmallRNA测序，LncRNA测序、CircRNA测序、全转录组测序等。另外我们根据中心法则，可以了解到mRNA(messenger RNA 的简称，又称信使RNA)，它由DNA经由转录而来，为下一步转译成蛋白质提供所需讯息，携带重要遗传信息，所以进行RNA的检测非常重要。

2肿瘤科医生如何参与测序与发表成果的完美结合？

在转录组测序中需要医生做什么呢，医生需要做的事便是负责提供样本，样本可以囊括“疾病vs正常”、“癌vs癌旁”、“原发vs转移”、“模型vs给药”、“癌症不同分期”、“癌症不同亚型”、“癌症治疗后不同阶段”。

3肿瘤科医生可以发表哪些肿瘤相关测序成果？

（1）肿瘤的基因表达分析

在肿瘤的发生和发展过程中，肿瘤细胞的基因表达谱在不同的病理阶段或诱导环境中是不同的（DNA是稳定双链的结果，所以不同的基因表达谱只能通过转录mRNA或其它RNA测量)。利用测序技术对不同基因表达谱进行大规模比较，从基因水平反映肿瘤情况，为肿瘤基因靶向治疗奠定基础。

研究方向：

1）肿瘤发生机制研究

2）肿瘤的分子分型；

3）药物筛选；

（2）肿瘤的可变剪接分析

具有不同功能的蛋白质通常可以通过可变剪接进行编码。最近的许多研究已经确定了由于选择性剪接导致的肿瘤转录组变异，以及大多数类型肿瘤中剪接因子和调控信号的突变。其中一些变化与肿瘤进展、转移、耐药性和其他致癌过程有关。

研究方向：

1）可变剪接作为生物标志物；

 2）可变剪接与耐药；

3）可变剪接作为治疗靶点；

（3）融合基因分析

融合基因（fusion gene）与多种癌症密切相关，检测体内的融合基因，可以有效预防癌症的发生和对癌症进行诊断、确诊。并可以根据基因靶向治疗的原理，对癌症进行治疗。

研究方向：1）染色体变异；

（4）肿瘤的非编码RNA分析

人类基因组剩余的非编码RNA 80%都是有功能的，这些序列的转录产物就包括大量的非编码RNA。ncRNA中除了众所周知的tRNA、rRNA等，多种具有调控功能的ncRNA越来越被大家所关注并且迅速成为研究的新热点。这些ncRNA往往具有组织和细胞特异性，在表观遗传调控、转录及转录后调控等水平参与蛋白编码基因的调控。

研究方向：

1）各种非编码RNA及其功能；

2）非编码RNA与肿瘤发生的机制；

（5）肿瘤耐药研究

肿瘤治疗过程中可能会产生耐药。近年来，转录组测序的开展可极大程度地辅助早期肿瘤的发现、以及晚期肿瘤药物耐药的判断，从而提高肿瘤的早期诊断、个体化治疗的效果以及预后等方面。

研究方向：肿瘤细胞耐药性机制研究；

（6）肿瘤早期诊断、预后以及治疗监测

血液的“液体活检”，渐渐取代创伤性的组织活检，被搬上了癌症诊断的舞台，如目前大热的液体活检，包括血清、血浆、外泌体等。而这些液体活检的基础便是高通量转录组测序。甚至在癌细胞和肿瘤微环境的基质细胞和免疫细胞的刺激条件下，液体活检变笨中的pre-mRNA能被剪接为成熟RNA,然后转化为功能性蛋白应对外部刺激，为肿瘤早期诊断、预后以及治疗监测提供了便利性和准确性。

研究方向：

1）肿瘤早期诊断；

2）肿瘤预后；

3）肿瘤治疗监测；

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