DimPlot散点图解决颜色叠加问题

问题:

有时候拿到的样本的UMAP图形如下:
灰色的细胞点多于紫色的细胞点,显示的结果都是都一个样本的细胞


F1.png

针对以上问题
DimPlot有个参数:shuffle可以解决这个问题

  • shuffle: 一个逻辑值,指定是否在绘制前随机打乱点的顺序。有助于避免绘图中的遮挡问题。
DimPlot(pbmc, reduction = "umap", group.by = "stim",cols = c("purple","grey"),shuffle = TRUE)

运行的结果:


F2.png

展示的结果相比较上面的结果样本之间的细胞显示效果更好一些。

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