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1.标量和向量的区分

变量.png

元素指的是数字或者字符串（用chr表示)

2.赋值

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
x

3.从向量中提取元素

根据元素位置

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

根据值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

3.数据框

（1）读取本地数据

read.table(file = "huahua.txt",sep="\t",header = T)
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep="\t",header = T)

（2）设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt')
X
colnames(X)
rownames(X)
colnames(X)[1]<-"bioplanet"

X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

（3）数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） 

（4）变量的保存与重新加载

#保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

（5）提取元素

X$列名
X[x,y]

直接使用数据框中的变量

options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)

简化操作case,values的提取
方法1：attach

将数据框名添加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)。

attach(a)
plot(case,values)
做完后将a删除出搜索环境 detach（a）

局限性：两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。
方法2：with

with(a,{
 plot(case,values)
x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行x