可以先尝试下面这两条命令：
install.packages("phytools")
remotes::install_github("liamrevell/phytools")
在安装过程中如果提示ape包版本低需要更新，记得更新。
如果R安装包退出状态的值不是0，可以换这个：
install.packages("phytools", type="binary")
一般都能安装成功，但是我安装成功之后library出现问题，提示我ape版本太低没办法library这个包，所以我就重新安装了ape。之后就能够成功library了。
image.png
参考：
完美解决 R安装包退出状态的值不是0 的问题！！_安装r包时出现退出状态不是0-CSDN博客
GitHub - liamrevell/phytools
