Emboss（The European Molecular Biology Open Software Suite）该软件包源于1988年开始开发的EGCG系统，是一个开放源代码的序列分析软件包。该软件包含160多个小型程序，涵盖序列比对、快速数据库搜寻序列、蛋白质模序及结构域分析、表达序列标签(EST)分析、核酸序列分析(例如CpG岛的识别)等多个领域。

emboss功能

序列比对

快速搜索数据库

蛋白质模块分析

核苷酸序列分析，包括寻找CpG岛，寻找重复

序列等。

小基因组的编码区分析，如寻找开放阅读框，

寻找EST等。

序列模式识别与翻译

安装emboss 6.5.7

安装plot 4.4

wget http://nchc.dl.sourceforge.net/project/gnuplot/gnuplot/4.4.0/gnuplot-4.4.0.tar.gz

tar zxvf gnuplot-4.4.0.tar.gz

cd gnuplot-4.4.0

./confugure

make

sudo make install

安装emboss依赖

sudo yum install libX11-devel

sudo ln -s /usr/lib/libX11.so.6 /usr/lib/libX11.so

sudo yum install libpng-devel

sudo yum install dvipng

sudo yum install libpng-devel

安装emboss

wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/EMBOSS/EMBOSS-6.6.0.tar.gz

tar -zxvf EMBOSS-6.5.7.tar.gz

cd EMBOSS-6.5.7

./configure

make

sudo make install

本文参考自 ：https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/70239881