R语言 热图-组学分组数据+归一化

R语言 热图-组学分组数据+归一化

使用R语言对组学数据进行归一化并绘制热图

结果速览

生成的热图

需要软件环境

Windows 10
R-4.0.4
R Studio: Version 1.2.1335

热图制作过程：

  1. 数据准备及导入
  2. 数据归一化
  3. 画热图

数据准备

CSV源数据

数据导入

输入下列指令，从CSV文件导入数据，出去表头，为（6+6+6）*85矩阵数据，赋给test1变量
test1 <-read.csv("C:/Users/Administrator/Desktop/YsJ/sz/zzwkP1.csv",header=TRUE)
输入test1显示下列

显示为矩阵形式的导入数据

归一化

输入如下指令,归一化矩阵数据，并赋值回来
test1 <- scale(test1)
结果如下图

归一化后的矩阵数据

续

生成热图

输入如下指令
pheatmap(test1)

生成的热图 Rplot02.png
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