python统计蛋白质序列中疏水性氨基酸所占比例

hydrophobic amino acid 疏水性氨基酸 疏水性氨基酸在蛋白质内部,由于其疏水的相互作用,而在保持蛋白质的三级结构上起作用。另外在酶和基质、抗体和抗原间的相互作用等各种非共价键的分子结合方面,具有重要作用,例如在抗体的与抗原结合的部位上有很多疏水性氨基酸,它参与与半抗原的结合。在维持生物膜的结构方面,疏水性氨基酸也具有作用,例如在红血球膜上存在的血型糖蛋白其膜内部分有许多疏水性氨基酸,形成一个疏水的区域。(百度百科)。疏水性氨基酸包括 A Ala 丙氨酸;C Cys 半胱氨酸; H His 组氨酸; L Leu 亮氨酸; M Met 甲硫氨酸; F Phe 苯丙氨酸;V Val 缬氨酸。大体思路就是先将序列写进字典然后再分个计数求和


PS:不太熟悉字典的用法,代码稍显繁琐

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