单细胞转录组和空间转录组的有些操作是基于@p,@x,@i这几个slot进行计算的。

而这几个slot并不是来自于seurat或其他单细胞对象的，

而是由Matrix包的稀疏矩阵dgCMatrix对象所携带的。

所以这几个slot的具体含义是什么呢

Matrix的官方文档给予了说法

```

i:

Object of class "integer" of length nnzero (number of non-zero elements). These are the 0-based row numbers for each non-zero element in the matrix, i.e., i must be in 0:(nrow(.)-1).

p:

integer vector for providing pointers, one for each column, to the initial (zero-based) index of elements in the column. .@p is of length ncol(.) + 1, with p[1] == 0 and p[length(p)] == nnzero, such that in fact, diff(.@p) are the number of non-zero elements for each column.

In other words, m@p[1:ncol(m)] contains the indices of those elements in m@x that are the first elements in the respective column of m.

x:

Object of class "numeric" - the non-zero elements of the matrix

````

但是觉得挺不讲人话

所以用通俗语言解释

@x 是把稀疏矩阵中所有的非零元素的值一一写出来(是按矩阵列的方向）

@i 是稀疏矩阵中所有非零元素的行索引值，也就是所有非零元素的行号

所以i的个数和x的个数是一样的多的。

但是这种索引类似Python，以0为起始

(是按矩阵列的方向）

@p 比较复杂，是一种计数累加

第一项是0，

第二项是原稀疏矩阵第一列的非零元素数目，

第三项是原稀疏矩阵第一列到第二列的非零元素数目之和，

第四项是原稀疏矩阵第一列到第三列的非零元素数目之和

后面每一项依次

(注意不是非零元素值之和)

(所以相数等于矩阵列数+1)

那如果想求每一列的元素数目呢，

用diff(.@p)函数

所以综上

@x是稀疏矩阵里元素的具体值

@p是元素的列信息

@i是元素的行信息

通过三者即可确定每一个元素，还原矩阵。