当年周芷若得了九阴真经之后和宋青书狼狈为奸，二人都窥探了九阴真经里精妙奥义的武功招式，只是苦于屠狮大会召开在即，时间仓促之下，周芷若和宋青书都只学了速成版的九阴白骨爪。
就在周芷若阴谋即将得逞之际，杨过的后人黄衫女飘然而至，她不仅用高深莫测的武功挫败了周芷若，更是揭开了周芷若虚伪恶毒的面具。周芷若被张无忌抛弃之后下落不明，宋青书则被武当派的俞莲舟打成废人，被武当弟子用担架抬回三清殿给张三丰发落。
武当众弟子正抬着宋青书缓缓地爬上武当山，此时的宋青书心知肚明，自己虽身为宋远桥之子，可陷害张无忌、杀死莫声谷、毒害张三丰的丑事早就人尽皆知。按照武当派的门规，自己所犯的每一件事都可以让自己身首异处，想到这里，宋青书不免黯然神伤。
不一会，众人眼前涌现一条极弯的山路，当武当众弟子抬着担架小心翼翼转弯之际，宋青书不知道从哪里冒出来的力气，只见他忽地一翻身就从担架上滑落，径直摔入了云雾缭绕的深谷里去了。
另一边，张无忌和赵敏在给杨逍、徐达等人交待完明教的大小事务后，他们二人前往蒙古隐居，再也不过问江湖里的是是非非。此时的江湖结束了风雨缥缈的厮杀，回归了以往的宁静和安逸，殊不知，此时只是暴风雨前的宁静，一场更大的血雨腥风正酝酿而生。
数年后，武当派的俞莲舟突然失踪。这件事惊动了一代宗师张三丰，毕竟俞莲舟的武功在武当七侠里数一数二，也是未来武当派的接班人，他的销声匿迹，让张三丰等人百思不得其解。
一日，在武当山修炼的张三丰突然得到了一个消息，山下的村民发现了俞莲舟的尸体，此时正准备抬进大殿。闻此噩耗的张三丰大吃一惊，他急忙起身赶往三清殿。
果然，一个担架横在地上，上面一动不动地躺着一个人。这个人脸上蒙着白布，看来已经气绝身亡，他身上的青袍正是俞莲舟平日里的穿着。
张三丰悲痛之下，步履蹒跚地走向俞莲舟，他缓缓地掀开白布，脸上早就挂满了泪水。就当白布即将掀开之际，只见“俞莲舟”突然化指为剑，于迅雷不及掩耳之势点向了张三丰的丹田之处。
张三丰虽为一代宗师，但毕竟年老体衰，加之万分悲痛之下疏于防范，只听“波”一声响，张三丰下丹田被点，气海翻涌之下，张三丰当即喷出一大口鲜血。
此时武当众人才发现，担架上的并非俞莲舟，而是多年前坠落悬崖的宋青书。宋青书早料到张三丰有纯阳无极功护体，自己的化指为剑并不能一击必杀，他一边狞笑一边缓缓掣出藏在袍中的一柄宝剑。
只见这柄剑闪耀着寒光，剑柄上刻着四个小字：紫薇软剑。武当众弟子见张三丰被袭，还没摆好阵型就被“村民”们团团围住，原来，这些村民也是假扮的。
宋青书知道张三丰非同小可，只要让他休息片刻，他就能运气疗伤立即生龙活虎。宋青书扬起软剑一个箭步冲向了张三丰，张三丰重伤之下唯有以一对肉掌招架。
让张三丰始料未及的是，此时的宋青书简直就是判若两人，他的剑法精益奥妙无比，每一招每一式都料敌机先，不仅如此，宋青书的出剑速度极快，攻得张三丰不得不守。加之张三丰下丹田被点，宋青书攻不到三招，张三丰就险象环生。
只听“噗嗤”一声，宋青书手中软剑以一个极其不可思议的角度刺向张三丰，张三丰的手掌顿时被宝剑刺穿，当场鲜血淋漓。
“独孤九剑之破掌式？你从哪里学来的这门剑法？”张三丰虽身受重伤，仍怒目圆睁地朝宋青书质问道。
“送你下地狱问阎王爷去吧！”只见宋青书手中宝剑好似一条银龙，以一个极其鬼魅的速度朝张三丰胸膛刺去。又是“噗嗤”一声，紫薇软剑穿胸而过，一代宗师张三丰就这样死在了宋青书的面前。
原来，宋青书当年坠落深谷之所以大难不死，和一头大雕有关。就在宋青书即将落地的那一刹那，谷底一头大雕鸣叫一声后立即振翅扑腾，宋青书的下落之势顿时就被大雕拍出的劲风卸去了一大半。即便如此，宋青书摔落之际依旧跌了个眼冒金星、昏迷当场。
当宋青书醒来后才发现，这个深谷人迹罕至，唯有一头大雕独居于此。这头大雕身高九尺，体型巨大，脑门上长了一个鲜红色的肉瘤让人见了不禁胆寒。
大雕虽然面目丑陋但颇通人性，它似乎看得出来宋青书身受重伤，它扑腾而去后，不一会儿又叼着一个蛇胆朝宋青书疾步走来。
宋青书吞下蛇胆之后只觉一股腥臭之气扑鼻而来，原来这蛇胆出自于菩斯曲蛇，菩斯曲蛇在古佛经上有记载，行走如风，极难捕捉。
大雕连续七日给宋青书叼来了蛇胆，宋青书在蛇胆的滋润之下有脱胎换骨之效，浑身骨骼经脉犹如新生。
见宋青书精神抖擞，大雕竟咬着宋青书的衣角带他去了一个极其隐蔽的山洞。宋青书走进山洞一瞧，只见洞内一角插着一柄宝剑，宝剑旁有一本羊皮卷，卷上记载的正是独孤求败的独孤九剑剑法。
原来独孤求败30岁之前用一柄紫薇软剑打败了无数高手，却不慎误伤了一位义士。独孤求败万分内疚之下将紫薇软剑和剑谱一起丢在了深谷之处，从此不知去向。这一次宋青书福缘深厚，误打误撞之下竟邂逅了大雕，得到了宝剑和剑谱。
宋青书索性就在山谷里住了下来，大雕也不知疲惫地每日给宋青书叼来蛇胆。宋青书悟性颇高，很快就领悟了独孤九剑的奥义，他的剑法在紫薇软剑的加持之下更是行云流水、威力惊人。
一日，宋青书心中意境大盛，他将剑法练到高潮之际，宝剑剑锋划过之处，竟隐隐传来雷鸣之声。
神功大成后的宋青书立即找到了陈友谅，二人一拍即合之下很快就发现了独自下山的俞莲舟。一想到当年被俞莲舟打成废人，宋青书就恨得咬牙切齿。他飞身而出，仅用了三招就刺死了俞莲舟。宋青书穿上了俞莲舟的青袍，又叫陈友谅喊了几个手下假扮村民，于是就有了开头的那一幕……
张三丰驾鹤仙去之后，远在蒙古的张无忌很快通过飞鸽传书得到了噩耗。怒不可遏的他带着赵敏重返中原，誓要将宋青书剥皮挫骨，替张三丰报仇雪恨。
让张无忌始料未及的是，此时的宋青书早就今非昔比，他的独孤九剑在九阴真经的加持之下更是厉害无比，甚至领悟了独孤九剑的最后一式：破气式！
张无忌的太极拳太极剑都被宋青书用破掌式和破剑式一一瓦解，他的乾坤大挪移和九阳真经也被宋青书用破气式攻得手忙脚乱、险象环生。
让张无忌更懊恼不已的是，自己和赵敏在蒙古放荡多年，早已不是童男之身。因为泄了元阳，张无忌体内的九阳真气大打折扣，早就没了当年的雄风。
不一会儿，张无忌肩头中剑，顿时跌落在地、鲜血淋漓。宋青书知道张无忌也是个非同小可之辈，今日若不斩草除根他日必卷土重来。只见宋青书一个飞身，手中宝剑直指张无忌的咽喉。
就在电光火石之间，赵敏挡在了张无忌面前。只见那把宝剑将赵敏胸膛戳了个窟窿，赵敏口吐鲜血，依旧含情脉脉地望着张无忌。
张无忌暴怒之下，运起仅有的一丝九阳真气准备和宋青书来个鱼死网破，突然眼前一个身影闪过，一位身穿黄衫的绝色女子飘然而至。她一把抓起张无忌，施展古墓派的绝妙轻功顿时就将宋青书甩在了身后。
张无忌被黄衫女提在手中，耳边传来呼呼风声，眼中的泪水再也按捺不住，顿时就泪流满面。他边哭嘴里边喃喃自语：“敏敏……敏敏……”
一顿饭功夫，黄衫女就带着张无忌来到了终南山下，在潜过了古墓门前的一条水道之后，二人走进了古墓内室。
由于亲眼目睹赵敏惨死在自己面前，张无忌为此足足消沉了半年的时间。好在黄衫女善解人意，在她精心的照料之下，张无忌渐渐有了起色。黄衫女告诉张无忌，当今世上，只有一门武功方能破了宋青书的独孤九剑。
原来，杨过离世之前，曾将黯然销魂掌的修炼方法留在了古墓。此时的张无忌无比悲愤、整日以泪洗脸，非常适合修炼这门以黯然神伤为意境的掌法。
黄衫女所言非虚，张无忌悟性极高，加之有九阳真经作为根基，他很快就将杨过的黯然销魂掌练得出神入化，全力击打之下，就算是千斤巨石也被其炸得粉碎。加之张无忌四肢健全，他的黯然销魂掌的威力比起当年的神雕大侠，有过之而无不及。
此时的宋青书也猜到了张无忌的藏身之所，只是苦于古墓断龙石的万斤之力，他和陈友谅纠集了千人也无法挖开断龙石。
就在宋青书等人在古墓门前叫嚷怒骂之际，张无忌从水道潜出杀了一个宋青书措手不及。宋青书也并非等闲之辈，他的独孤九剑很快就发挥了威力，只见二人你一掌我一剑，顿时飞沙走石、罡风扑面。
黄衫女担心张无忌的安危，她随后也潜出水道在一旁观看这激烈异常的生死对决。宋青书的独孤九剑已臻化境，在紫薇软剑的依仗之下已到了随心所欲的境界。张无忌的黯然销魂掌虽然刚猛无比，可在独孤九剑面前似乎还缺了点什么似的。
二人越打越快、越斗越凶险，只听“噗嗤”一声，张无忌的大腿被宋青书用剑划破，宝剑锋利无比，张无忌顿时血流如注。一旁的黄衫女见状情不自禁地“啊”了一声，宋青书扭头一瞧是黄衫女不由得火冒三丈，毕竟自己多起好事都被黄衫女从中搅黄。宋青书不理会张无忌，一个飞身，手中长剑犹如蛟龙出海径直朝黄衫女刺去。
“下去陪赵敏去吧！”宋青书嘿嘿冷笑道。
就在剑尖即将触及黄衫女之时，宋青书只觉身后有一股不可思议的大力袭来，他还没来得及转身，就被张无忌用一招黯然销魂掌的“穷途末路”击中，顿时口吐鲜血，当场毙命。
原来，眼见黄衫女就要命丧当场，张无忌本来就焦急万分，加之宋青书又无意在张无忌面前提及了香消玉殒的赵敏，张无忌无限悲痛之下，胸臆间竟充满了黯然神伤之情。
悲痛万分的张无忌情不自禁地使出了黯然销魂掌的最后一招“穷途末路”，这一掌威力极大，加之宋青书又背对张无忌，于是这一掌的劲道尽数打在了宋青书身上，即便宋青书神功卓绝，也被张无忌当场打死。
眼见大仇得报，晃过神来的张无忌抱着黄衫女失声痛哭。黄衫女毕竟年长张无忌几岁，她柔声安慰了张无忌几句后，牵着张无忌的手再一次走进了古墓……
那一把紫薇软剑，也被黄衫女抛在古墓门前的水道深处，它的下一任主人又会是谁呢？只见密林里一个倩影晃动，她竟是躲在一旁默默观战的周芷若……
