使用fastuniq去除fastq中的PCR重复

二代测序的去重是非常重要的一步，常规的方法都是在比对到基因组之后利用基因组位置的信息来去重，这样效率比较高，但有些时候我们要在拿到测序的fastq文件的时候就去重。

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这样的算法有一些，都不算特别主流，经测试，最容易安装的就是fastuniq，文章于2012年发表于plos one，方法也很暴力，就是去除一样的reads。
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安装使用非常简单，可以参考如下的链接http://blog.sina.com.cn/s/blog_670445240101lqat.html
使用过程中一个非常大的问题，输入只能是fastq文件，不能压缩，不能压缩，不能压缩！
使用它处理一对文件，输入为fq文件，输出为fastuniq文件，攻占用了49G内存，大约运行了十分钟，速度还可以接受。
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