生信学习小组Day4--康康

今天开始学习R语言啦

1. R和Rstudio

1.1 R是什么

(1)R是一种编程语言,汇集了许多函数,能够提供统计、绘图等若干功能

(2)R语言软件界面简单,通常使用Rstudio来操作

1.2 Rstudio是什么

通俗的理解是R的可视化,它是R的操作平台

注:查看你的电脑用户名是中文还是英文(这一步特别特别重要,一定要做)
先在电脑桌面随便打开一个文件夹

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如果是英文,就可以直接进行安装了,如果是中文,必须改为英文,否则无法安装
我的是英文,没有进行这一步操作,如果你的是中文,在此安利一下大神的教程

来自:生信星球
当Rstudio杠上中文用户名

2. 下载R和Rstudio

2.1 下载R

通过网址 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

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选择对应自己电脑的版本
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然后就是下载后安装

2.2 下载Rstudio

通过网址 https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/

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选择自己需要的版本下载安装即可

3. 认识Rstudio

3.1 Rstudio界面

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认识完界面,试练一下
(1)在脚本编辑区输入plot(rnorm(50))
plot:plot()函数是R中基本的画x-y两个变量的函数
runif函数:随机分布函数
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(2)在脚本编辑区输入boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
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注:iris是一个R语言自带的数据框,通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据

3.2 Rstudio显示设定

操作流程:Tools—Global Options—Appearance—Editor font size—Apply

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4. R语言的基本用法及操作

4.1 用Rproject管理工作目录

设置工作目录:setwd()

查看工作目录:getwd()

所谓工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到
引用:https://m.umu.cn/session/article/29dNB82ec?fwx=1
R只能对应一个工作目录,但如果遇到多个项目,需要对应多个工作目录,R project就很有必要了
R可以同时打开多个Rproj文件,他们处于多个独立的Rstudio界面中,不会相互影响。如果仅仅创建R脚本,不创建Rstudio项目,则不同的R脚本只能处于同一个Rstudio界面中,共享一个工作路径,也共享环境变量,可能相互影响,这时两个R脚本不能同时运行
引用:https://bookdown.org/xiao/RAnalysisBook/r.html

微信图片_20200421000443.png

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新建成功

4.2 显示文件列表

代码:dir()

4.3 基本运算

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4.4 对变量进行赋值

赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号
x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x, 赋值后,x会显示在右上角的框,Environment里的Value列表里
直接输入x 回车,就会把x的值(3)打印到控制台上,前面的那个[1]是结果的第一个,不用管他

引用:https://m.umu.cn/session/article/29dNB82ec?fwx=1

微信图片_20200421003343.png

4.5 删除变量

清除单一变量:rm(变量名称)

清除多个变量:rm(变量1,变量2)

一键清空批量删除:rm(list = ls())#清空所有变量(此时右侧Enviroment就空了)

4.6 列出历史记录

history()相当于鼠标单击右上角的history标签

4.7 清空控制台

Ctrl+L

注:一定一定要在英文输入法下输入命令行中的符号

最后附一张思维导图

R语言基础.png
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