三代组装metaFlye

github: https://github.com/fenderglass/Flye

安装

conda create -n Flye
conda activate Flye
conda install bioconda::flye

source /hwfsxx1/ST_HN/P18Z10200N0423/huty/software/miniconda3_2/etc/profile.d/conda.sh
conda activate Flye

使用

flye \
--pacbio-raw 00_rawdata/Y23030000014675.rmhost.nanofilt.fq.gz \
--out-dir 01_assembly/04_metaflye \
--meta \
--threads 24

参考
一文看懂三代组装软件——Flye

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