Gene ID转换

生物信息中用到的IDs Conversion的相关工具:

1. DAVID: The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discover http://david.abcc.ncifcrf.gov/conversion.jsp.

数据不能及时更新。

2. Biomart: http://www.biomart.org/biomart/martview/65c2ea6c079d1b85820fa5bbf5af62b5

这是一个绝对不错的东东,定期发布新版本,而且可以将数据下载到本地进行操作,推荐一下...

3. BioDBnet: http://biodbnet.abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php

4. Hyperlink Management System (HMS): http://biodb.jp/

5. BridgeDB: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/5

5. Uniprot 也提供了比较好的转换工具:http://www.uniprot.org/ (ID Mapping)

6. KEGG 的API : http://www.kegg.jp/kegg/rest/keggapi.html (conv)

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