然而，就是这次结婚不久，萧红就对端木蕻良有了许多抱怨，据作家聂绀弩回忆，萧红常在他面前说端木蕻良是个胆小鬼、势利鬼、马屁鬼，一天到晚在那里装腔作势的……萧红还说，和萧军分手是一个问题的结束，和端木蕻良结合，是又一个问题的开始……萧红的这些抱怨似乎不是空穴来风，在武汉，挺着大肚子的萧红要自己洗衣做饭，“做了饭，还要饿着肚子等端木蕻良起来吃饭”……端木蕻良一气之下打了佣人，自己却躲在屋子里不出来，萧红想方设法为他摆平了事情……广州失守，战乱很快殃及武汉，萧红在朋友们帮助下，弄到一张很难弄到的到重庆去的船票，可是坐船走的不是怀着孩子的萧红，而是端木蕻良……萧红说，端木蕻良是个没有能力的人，不会照顾自己，也就不会照顾了我……
端木蕻良去了重庆，说是去打“前站”，留下萧红一个人在武汉，连住的地方都没有，她只得去找朋友蒋锡金，在蒋的屋子里打地铺就睡下了，说“我太累了”……这大约是萧红当时从内心到身体上真正的“累”……
后来，是蒋锡金又为萧红购置了船票，并资助萧红100块钱，还安排一个女伴陪同萧红去重庆……那个女伴半途下船，身体不方便的萧红只好只身一人去重庆。她说，我总是一人，一个人在赶路，总是孤孤单单的一个人……感叹说，生活为什么那么痛苦？！到重庆后，在朋友白朗家里，萧红生下了和萧军的孩子，据说这个孩子白白胖胖，很健康，长得很像萧军……可是这个孩子三天后却死了，死因不明，萧红解释说是孩子因抽风而死……结果是萧红再一次失去了做母亲的权利……这个孩子在作家萧红笔下没有任何的文字记述……同时，萧红和萧军的血缘关系也就此彻底割断了……
1939年，萧红因患上肺结核病，她和端木蕻良一起飞往香港。在香港，端木蕻良教书、写作，萧红操持家务，不断创作，她写了成名作《呼兰河传》，还写鲁迅的话剧，并写了小说《马伯乐》，那段时间她在作家圈里很活跃……可惜《马伯乐》还没有写完，她就不断生病，不断住院，就到了无法掂笔的时候……那时候的端木蕻良因为忙于文学事务，并没有多少时间照顾萧红……特别是萧红被庸医误诊割断了喉管之后，在她生命最后的44天里，照顾和陪伴她的是一个叫骆宾基的青年。骆宾基比萧红小6岁，这个年轻人喜欢萧红的作品，崇拜萧红的才华，据说他也是第一个为萧红写传记的人……还据说，萧红有个心愿，就是病好了，要嫁给这个叫骆宾基的年轻人……44天时间里，端木蕻良似乎只有三次去到了萧红的病房……
1942年1月22日，萧红在香港病逝，享年31岁。
