HiC学习记录(四)——数据分辨率

参考文献:Rao S S P, Huntley M H, Durand N C, et al. A 3D map of the human

genome at kilobase resolution reveals principles of chromatin

looping[J]. Cell, 2014, 159(7): 1665-1680.

在以上文章中,研究者描述 Hi-C 数据分辨率的评估方法:分辨率为 1Kb 表示在全基因组 1Kb 的 bin 中,超过 80%的 1kb 的 bin 含有>1000 个有效 contacts ;

有效数据:N ; 基因组大小:G ;分辨率:R

具体计算如下:

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。