R语言学习笔记-R包安装
by cici
R语言是一个开放性的统计学语言，r包的丰富程度涵盖了几乎生产和生活的各个方面，r包与r包之间错综复杂的依赖关系也足以限制人们的想象力。并且R package的数据源（CRAN/Bioconductor/github）与维护人员不同，R包安装并无统一的标准，造成安装产生的错误花样百出，这使得大批的R语言爱好者死在了安装R包的路上，本人在R语言的学习过程中总结了一些R包安装的tips，希望对大家有帮助：
我的安装思路如下：
1、得到所需要安装的R包名（代码运行提示、教程、说明书提供等）；
2、分析R包属于哪个数据源
3、针对对应数据源进行下载（熟记以下安装脚本）
###CRAN
install.packages()
###Biocductor
BiocManager::install()
###Github
devools::install_github()
4、当你成功安装R package但无法正确运行程序时别忘了library(’R package')，如果还不行，尝试update依赖的R包
常见错误处理：
1、R 包下载速度过慢或根本无法完成下载
- 更换镜像，国内镜像不一定是最快的
- 更换更快的网络，手机的热点有时比光纤要好
- 更换ISP（电信/联通/移动/教育网等）
- 使用代理
- 更换下载时间
- 求助别人下载后在进行本地安装
- 以上几种方式排列组合并不断尝试
2、如显示R package is not availble to R version xxxx.或者require 更高版本的R,这时需要重新下载对应版本的R或者去github搜索合适的版本的R package安装
3、学会使用Tab键，在键入R语言命令时用Tab+上下键选择，R命令返回缺失的R包时尽量用copy和paste操作，最大限度减少人为因素造成的错误。
4、中文字符与大小写问题，R语言无法识别中文字符，如引用R包的“”，输入代码时应该确保输入法处于英文状态；
5、求助Google与度娘。
以上几步应该能够解决大部分的问题，如果很不幸在走投无路的时候（已排除任何人为因素造成的错误），我会这样做（仅供参考）：
- 重启R（常常会有效）
- 重启电脑
- 重装R
- 更换操作系统
- 更换电脑
- 某些少见的r可能从镜像删除需要联系r包的作者获得
- try more.
最后感谢，jimmy的生信技能树团队、jimmy、孙小洁，慧美等老师的悉心指导和鼓励！
