生信星球学习小组第29期第五天

5种基本类型的对象

字符character

双引号或单引号夹起来，如“字符”

赋值 orange 为字符串 red、green、yellow，显示字符串，查看字符串数据类型，计算字符串长度。

# Create a vector
orange <- c('red','green',"yellow")
print(orange)
[1] "red"    "green"  "yellow"

# Get the class of the vector
print(class(orange))
[1] "character"

length(orange)
[1] 3

证书integer

复数complex

如x+ab

逻辑logical

true/false

逻辑假和真的几种形式，查看逻辑假的变量类型。

# 假
F / FALSE / 0

F       
[1] FALSE

# 真
T / TRUE / !0

class(T)
[1] "logical"

数值numeric

整数、小数、科学计数的方式，默认双精度型数据，real numbers

6种储存数据的对象类型：

因子factor

分类型数据需要把数据分为不同的水平，如性别分为男女两个因子

向量vector

有相同基本类型元素组成的序列，相当于一维数组

赋值变量 x 为 1,2,3 / 1,2,3,4,5,6,7,8,9; 取值 2,3 / 3 / 3,2,1; 输出字符串和变量(myString) Hello World；输出 3.9 与 1.6 之和。

x<-c(1,2,4) / x<-c(1:9) / x[c(0,0,1)]
x
[1] 1 2 4
c(1,2,4)->x
x
[1] 1 2 4
x[2:3] / x[3] / x[c(3,2,1)]
[1] 2 4
print("Hello World")
[1] Hello World  
# Add two numbers
print(3.9 + 1.6)
[1] 5.5
myString <- "Hello, World!"
print ( myString) / cat(myString,"\n")
[1] "Hello, World!"

赋值隐藏变量 a 为 2,3,4，var_123 为 123；显示所有变量、隐藏变量；正则 var*；删除隐藏变量 a；显示所有变量。

.a<-c(2,3,4)
var_123=123
ls()
[1] "a"       "var_123"
ls(all.name=TRUE)
[1] ".a"      "a"       "var_123"
ls(pattern="var")
[1] "var_123"
rm(.a)/remove(.a)
ls(all.name=T)
[1] "a"       "d"       "var_123"

矩阵matrix

以 1,2,4,8（cells、rnames、cnames）构建矩阵 mymatrix
C1 C2
R1 1 2
R2 4 8

cells<- c(1,2,4,8)
rnames<-c("R1", "R2")
cnames<-c("C1", "C2")  
mymatrix<-matrix(cells, nrow=2, ncol=2, byrow=TRUE, dimnames=list(rnames, cnames))
mymatrix 
#       C1   C2
# R1   1     2
# R2   4     8

矩阵

列表list

向量、矩阵和数组的元素必须是同一类型的数据，但是如果一个数据对象需要含有不同的数据类型，则采用列表

g(title) 为 My First List, h(ages) 为 25, 26, 18, 39, j 为 1~10(5行)的矩阵，k 为字符串 one, two, three 建数据列表 mylist；

g<-"My First List"
h<-c(25, 26, 18, 39)
j<-matrix(1:10, nrow=5)
k<-c("one", "two", "three")
mylist<-list(title=g, ages=h, j, k)
mylist

$title
[1] "My First List"

$ages
[1] 25 26 18 39

[[3]]
     [,1] [,2]
[1,]    1    6
[2,]    2    7
[3,]    3    8
[4,]    4    9
[5,]    5   10

[[4]]
[1] "one"   "two"   "three"

列表

数组array

一维数组是向量，二维数组是矩阵。向量和矩阵的推广

数据框data.frame

一种矩阵形式的数据，可以是不同类型的数据。

patientID 为 1, 2, 3, 4，age 为 25, 34, 28, 52, diabetes 为 Type1, Type2, Type1, Type1，status 为 Poor, Improved, Excellent, Poor 建数据框 patientdata。

# method 2
patientID <- c(1, 2, 3, 4)
age <- c(25, 34, 28, 52)
diabetes <- c("Type1", "Type2", "Type1", "Type1")
status <- c("Poor", "Improved", "Excellent", "Poor")
patientdata <- data.frame(patientID, age, diabetes, status)
head(patientdata)
#  patientID age diabetes    status
#1         1  25    Type1      Poor
#2         2  34    Type2  Improved
#3         3  28    Type1 Excellent
#4         4  52    Type1      Poor

数据框