1.非root环境下linux中perl的安装（最重要的步骤）
（1）在官方网站下载新版本的源码包：http://www.perl.org/get.html，版本自己选择
（2）解压
# tar zxvf perl-5.18.0.tar.gz
（3）进入解压目录
（4) 编译
./Configure –help的提示如下:
./Configure -des -Dprefix=/home/XXX/software/perl-5.18.0
make //这个过程会比较久，因为源码文件有那么大。
make install
等待这个命令完成后，基本安装就完成了。
(5) 更改路径
vim ~/.bashrc
在里面添加：
export PATH=/home/XXX/software/perl-5.18.0/bin:$PATH
保存，更新路径：
source ~/.bashrc
这样就能保证你安装不需要root权限，在以后安装模块时，也不需要root权限了。
那么怎么在无root的情况下安装模块了？
方法一：安装上面的方法安装perl之后，安装模块用cpan也不需要root权限了：
perl -MCPAN -e shell
方法二：手动安装模块：
进入模块所在路径，就是你的模块安装到哪里，你就cd进去，然后执行下面的命令…
perl Makefile.PL PREFIX=/home/zilhua/software/perl-5.18.0/lib
make;
make test;
make install
注意PREFI的格式，必须要写成这几个字，前面不能加-或者–，不能小写
2. 设置环境变量，使当前系统的perl程序能够自动找到安装的模块
vim ~/.bashprofile 添加
export PATH=/home/zilhua/software/perl-5.18.0/lib
保存并关闭.bash_profile文件
按照上面的方法更新路径
注意：一般手动安装的模块最后还需要自己重新改一下名字的。
方法3：使用模块 local::lib（不推荐）
先手动安装这个模块，然后再用这个模块安装其他模块。
http://search.cpan.org/~haarg/local-lib-2.000004/lib/local/lib.pm
以下是详细步骤：
tar -xzf local-lib-2.000004.tar.gz
cd local-lib-2.000004.tar.gz
下一步，将local::lib加入至bootstrap当中去。这一步会在用户HOME目录下新建一个perl5的目录，并且指定它为将来安装perl模块的目录。
perl Makefile.PL –bootstrap
而后安装local::lib
make
make test
make install
而后试运行一下perl
perl -MCPAN -e shell
一路选择默认值，然后退出。这一步，perl会将本地的模块搜索目录放入至.bashrc文件尾部。
安装其它perl模块
这个时候我们就可以进行非root权限的perl模块安装了。我们首先需要从先前的terminal窗口中退出来，重开一个terminal窗口，这样就会过一遍.bashrc文件。试着安装一个模块，
perl -MCPAN -eshell
nolock_cpan[1]> install File::ReadBackwards
一切OK。
为cluster扩展library path
可以简单的在qsub文件中运行perl之前加入PERL5LIB的搜索路径
echo $PERL5LIB
然后将传回的值写入qsub当中去
PERL5LIB=/home/path/lib:/usr/another/path/lib; export PERL5LIB
也可在执行命令中加入-I参数
perl -I /home/path/lib -I /usr/another/lib script.pl
或者在pl文件头里加入lib的路径
!/usr/bin/perl
use lib “/home/path/lib”;
use lib “/usr/another/lib”;
use MyCustomModule;
参考文献：https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/78790674
2.perl中所需模块的安装
3.对于Remap的安装使用
参考链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/tools/remap/docs/api
