利用 APT 技术在编译期生成代码
简介：
APT(Annotation Processing Tool 的简称)，可以在代码编译期解析注解，并且生成新的 Java 文件，减少手动的代码输入。现在有很多主流库都用上了 APT，比如 Dagger2, ButterKnife, EventBus3 等。其实AspectJ也是通过apt的方式来实现动态代码生成，但一般作用域后端，移动端集成过于复杂很少使用，感兴趣的可以参考：http://linbinghe.com/2017/65db25bc.html。
参考：http://brucezz.itscoder.com/use-apt-in-android
通过自定义Gradle插件修改编译后的class文件
简介：
考虑这样一种应用场景，为每个编译后的class文件添加一行代码。比如：在每个Java类的构造函数中加一句System.out.println("xxxx");如果你每次创建一个类的时候都手动加这么一句话，先不谈容易出错，我们说说工作量。或许你觉得，你愿意手动加，那我再跟你提新需求，我现在不要这句代码了，我估计你会想要骂x，但是通过Gradle 的Transform api就可以轻松的实现。
参考：http://www.jianshu.com/p/417589a561da
总结
区别
APT:作用的生命周转期为x.java->x.class，具体的实现方式为通过Annotation 在编译器动态生成相应的代码（Annotation 的另一个作用是运行时注解：http://blog.csdn.net/github_35180164/article/details/52118286），常见于第三方框架。
Gradle插件： 作用的生命周转期为x.class->x.class，就是将已经生成的.class文件通过api插入自己的逻辑，再将新生成的.class文件导出到原来的目录，具体方式为通过project.android.registerTransform注册相应的Transform实例，常用于自己的项目，比如项目中要在某些地方添加一些相同的业务逻辑同时又不想入侵项目时推荐使用。
