学习小组day6笔记-明明洁

今日主题:学习R包

安装和加载R包:

镜像设置:

生信星球推送中的教程很详细,参见此处,最推荐使用其中的第三种方法:配置文件.Rprofile。

安装:

  • 存在于CRAN网站的包安装命令 install.packages(“包”)。
  • 存在于Bioconductor网站的包安装命令 BiocManager::install(“包”)。

加载:

library(),require(),这两个命令均可。

dplyr包的用法:

五个基础函数:

  • 新增列:mutate(数据集,新列=)
  • 筛选列:select(数据集,列号or列名)
  • 筛选行:filter(数据集,列名的判断条件)
  • 按某列或某几列对整个表格进行排序:arrange(数据集,列名) #默认升序排序,用desc(列名)实现降序
  • 汇总:summarise(数据集,mean(某列),sd(某列))

两个实用技能:

  • 管道操作 %>%:加载任意一个tidyverse包均可使用。
  • count 统计某列的unique值:count(数据集,列名)。
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