你好啊，jupyter

jupyter 简史

jupyter 是一个开源的web应用程序，允许我们创建和共享包含实时代码、方程式、可视化和叙述性文本的文档。用途包括:数据清理和转换，数值模拟，统计建模，数据可视化，机器学习，以及其他你能想到的一切。JupyterLab是一个基于web的交互式开发环境，用于Jupyter笔记本、代码和数据。JupyterLab是灵活的:配置和安排用户界面以支持数据科学、科学计算和机器学习中广泛的工作流。JupyterLab是可扩展和模块化的:编写插件来添加新组件并与现有组件集成。

在数据科学领域，jupyter 已经形成相对完善的计算生态：

很多人在用python后不久就会接触到它，轻便，安全的jupyter notebook：

不喜欢这个主题，你还可以jupyter notebook使用技巧（1）：更换主题

Jupyter Notebook的主要特点：
https://jupyter-notebook.readthedocs.io/en/stable/notebook.html#introduction

编程时具有语法高亮、缩进、tab补全的功能。可直接通过浏览器运行代码，同时在代码块下方展示运行结果。以富媒体格式展示计算结果。富媒体格式包括：HTML，LaTeX，PNG，SVG等。对代码编写说明文档或语句时，支持Markdown语法。支持使用LaTeX编写数学性说明。

感觉说的好像Rstudio啊。

jupyter 安装

建议用conda 安装：

conda create -n my-conda-env         # creates new virtual env
conda activate my-conda-env          # activate environment in terminal
conda install jupyter                # install jupyter + notebook
jupyter notebook

生成配置文件，一般在家目录下。

jupyter notebook --generate-config

在ipython中，生成密码

ipython

from notebook.auth import passwd
passwd()
Enter password:
Verify password:

Out[1]: 'sha1:etbeguiuetejdnimjnewysgnbwyumksnwy6j346tehwsh'

把生成的密文 'sha1:etbeguiuetejdnimjnewysgnbwyumksnwy6j346tehwsh' 记录下来，复制到一个地方，备用。

vim ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py

打开之后，都是被注释掉的，修改jupyter notebook配置，添加关键信息。

c.NotebookApp.ip='*' # 设置所有ip皆可访问
c.NotebookApp.password = u'sha1:ce...刚才复制的那个密文'
c.NotebookApp.open_browser = False # 禁止自动打开浏览器，如果服务器有浏览器也可以不修改这一项
c.NotebookApp.port =8888 #随便指定一个端口
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启动jupyter notebook

jupyter notebook   --no-browser --port=8888    --ip=127.0.0.1 --allow-root   

[I 18:01:40.591 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /pathto/result
[I 18:01:40.592 NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at:
[I 18:01:40.592 NotebookApp] http://127.0.0.1:2000/
[I 18:01:40.592 NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).

转到我们的mobaXterm上面，主要是要找到在哪里填信息。

mobaXterm远程连接jupyter notebook

启动mobaXterm ，使用SSH连接，点击上方的Tunneling，添加SSH tunnel，选择Local port forwarding。

然后如下填写信息，本地端口填8888（之前c.NotebookApp.port设置的端口），远程服务器填127.0.0.1和8888。sshsever填写ssh的登录ip和端口。保存。

配置好，运行。当服务器出现：

 404 GET /api/contents/velocyto/scvelo.ipynb?type=notebook&content=0&_=46643794763820020239844(127.0.0.1) 3.81ms referer=http://127.0.0.1:8888/notebooks/velocyto/Untitled.ipynb?kernel_name=python3

时，说明已经链接好了，这时在浏览器输入http://127.0.0.1:8888/ 就可以打开jupyter了；

切换jupyter的python版本

这个完全时根据Rstudio的联想，python中经常需要切换版本，所以是可以的。

在jupyter的kernels目录下可以配置python的把版本：~/.local/share/jupyter/kernels/my-conda-env-kernel/kernel.json

{
 "argv": [
  "/opt/miniconda3/envs/my-conda-env/bin/python",
  "-m",
  "ipykernel_launcher",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ],
 "display_name": "my-conda-env-kernel",
 "language": "python"
}

改完之后，我们重启jupyter 就可以了。

https://jupyter.org/
如何使用mobaXterm远程连接jupyter notebook
服务器端jupyter notebook映射到本地浏览器
 How to use Jupyter notebooks in a conda environment?