单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing)是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实
文库原理:
技术流程和优势:https://zhuanlan.zhihu.com/p/182492634?utm_source=wechat_session
一个油滴 (GEM)=一个单细胞+一个凝胶微珠=一个scRNA-Seq
名词解释:
reads 1 :主要用来标记(barcode、UMI以及reads的来源)
reads 2 :与基因组比对 (配合UMI进行定量)
UMI:(Unique Molecular Identifier):标记转录本
Barcode: 标记细胞
PolyT :捕获成熟的RNA
https://mp.weixin.qq.com/s/qLqIA7Y3J9xf_tXlQj0FAw