把之前写在CSDN的博文搬运了过来，集中记录自己的学习过程。

首先了解 conda、Anaconda、Miniconda的关系
昨晚在修改bashrc文件时服务器突然掉线了，导致bashrc文件不正常关闭，结果临时生成了.bashrc.swp文件，再次编辑bashrc文件会提示该文件已存在。

原因：在用vim打开一个文件时，其会产生一个cmd.swap文件，用于保存数据，当文件非正常关闭时，可用此文件来恢复，当正常关闭时，此文件会被删除，非正常关闭时，不会被删除，所以提示存在.swap文件。

rm .bashrc.swp    #这样文件就被删除了

1.下载Miniconda
选择的是清华镜像里的版本：
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
source ~/.bashrc #然后别忘了点击Enter!昨晚安装就是死在这一步了

然后等一会就会出现python安装成功的提示。
然后提示是否将miniconda3安装路径加入到环境变量，输入yes。如果不输入或输入no的话也可以，就是要手动修改环境变量，不过还是能不动就不动吧。。
亲证重启终端才能使用：
进入miniconda3目录下，conda list #查看已安装的库文件 ；

2.配置conda的镜像仓库

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free  #官方频道
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge  #conda软件管理依赖环境解决频道
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda  #生物信息软件频道
conda config --set show_channel_urls yes

以上均参考：HiC数据分析实战

下午我又来了，原因是我发现miniconda3安装在了家目录下，于是我自作聪明得把整个miniconda3文件夹移到app下面后，还修改了原有的环境变量路径，，结果就是发现miniconda没法用了。于是乎：

rm -rf miniconda3  #所有的文件都在这一个文件夹里，所以删除这个文件夹就行
#然后注释掉或者删除之前添加的路径
#重启终端，不然可能还是绑定有anaconda

重新安装吧，别忘了进入app目录下再下载安装。
我又又来了，还是没用，还是会自动安装到家目录下，即使安装包还是躺在app目录下。。未解之谜

8.7补充：
听课的时候看到这篇文章：conda is a snake

conda请最好是通过source启动，一定要用conda安装不同功能的软件各个env，免得它污染环境变量，使用某些软件，就激活某些env。

吓得我赶紧去修改了.bashrc文件。怎么手动启动conda呢？

source ~/miniconda3/bin/activate
#然后用户名前面会出现(base)，表示我们处在conda的环境下

修改bashrc文件后我测试了一下，发现仍然可以直接调用conda，这可能是因为系统里已经有conda存在了，所以可以直接调用。
另外，创建虚拟环境真的是个良好的习惯。