肠道菌群 and 心血管疾病 30782617 软件利用的比较好，数据分析充分
入组人群：307人 纳入标准 排除标准 307名符合条件的受试者被随机（1:1:1）分为三种不同膳食脂肪比例的一种，按研究中心、年龄、性别和体重指数使用计算机生成的随机数字表进行分层。经过6个月的控制性喂养干预，245名参与者（79.8%）完成了整个试验。其中，共有217名在基线和试验结束时提供粪便样本的受试者被纳入16srrna序列测定。此外，在16srrna测序后，120名有足够粪便样本的受试者（每个饮食组40名）被进一步纳入粪便代谢组分析
采集血样并评估促炎因子 ：脂质、葡萄糖和胰岛素。6血浆促炎因子浓度，包括白细胞介素（IL）－1β、白细胞介素－6、白细胞介素－8、肿瘤坏死因子－α（TNF－α）、前列腺素E2（PGE2）、血栓素B2（TXB2）和白三烯B4（LTB4）高敏C反应蛋白（hs-CRP）
在基线和6个月干预结束时收集粪便代谢组样本的16srrna测序和测量 提取DNA、用条形码索引引物338F（5'-actcctagggggcagcag-3'）和806R（5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3'）扩增细菌16srrna基因V3-V4高变区 PRJNA480547
数据统计：
正态分布的Kruskal-Wallis检验 用morsur法计算了评价肠道微生物群落丰富度的α-多样性指数（Ace和Chao1估计）和群落多样性指数（Shannon估计），并用基于Bray-Curtis距离的主坐标分析（PCoA）和置换多元方差分析（PERMANOVA）对其进行了比较在门、属和操作分类学单元（OTU）水平上
Spearman秩或Pearson相关性计算
采用单位方差标度正交投影-潜在结构判别分析（OPLS-DA）对各组干预前后微生物代谢产物的总体分布进行了研究
Benjamini-Hochberg方法对p值进行单变量分析
以Bray-Curtis距离和PERMANOVA为基础，分别在基线和干预后，在门、属和OTU水平上比较三组间的全球微生物组成。采用单位方差标度法和变异系数方差分析法（CV-ANOVA）对3组患者在基线检查和干预后的总体微生物代谢产物分布进行了研究。各组FDR校正后细菌和粪便代谢物变化显著，采用Wilcoxon试验比较各组间的变化。OPLS-DA和CV-ANOVA采用SIMCA-P+version 14.0软件进行，其余统计分析均采用R version 3.4软件进行。
粪便代谢物变化与属丰度变化的相关性
粪便代谢物变化与属丰度变化的相关性，热图显示了粪便代谢物浓度变化与各属相对丰度变化之间的Spearman相关系数。颜色的强度表示粪便代谢物浓度的变化与各属相对丰度的变化之间的关联程度，用Spearman的相关性来衡量。使用Benjamini-Hochberg错误发现率校正多个测试的P值。
